More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3268 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  58.3 
 
 
251 aa  291  8e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  58.3 
 
 
257 aa  288  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  55.87 
 
 
252 aa  279  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  55.47 
 
 
251 aa  279  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
251 aa  276  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  55.06 
 
 
250 aa  272  5.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  59.04 
 
 
253 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 
251 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  53.23 
 
 
250 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  58.37 
 
 
654 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 
251 aa  262  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  53.6 
 
 
250 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  51.82 
 
 
250 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  55.02 
 
 
253 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  54.58 
 
 
252 aa  261  1e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  53.04 
 
 
251 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  54.13 
 
 
255 aa  259  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  52.63 
 
 
251 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 
253 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  54.22 
 
 
250 aa  256  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  58.63 
 
 
253 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
251 aa  254  7e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  53.66 
 
 
249 aa  251  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  53.39 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  49.19 
 
 
250 aa  248  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  51.98 
 
 
251 aa  248  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
248 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  50.6 
 
 
251 aa  246  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 
248 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  52.03 
 
 
248 aa  246  3e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  49.2 
 
 
254 aa  245  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
254 aa  244  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  47.56 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  52.8 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  53.44 
 
 
251 aa  241  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 
257 aa  239  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  50.41 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  50.81 
 
 
249 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.02 
 
 
646 aa  238  8e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  48.75 
 
 
243 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 
249 aa  236  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
249 aa  235  4e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  52 
 
 
252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  47.97 
 
 
253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 
256 aa  234  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  50 
 
 
251 aa  234  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  48 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  48.19 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  45.78 
 
 
252 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  46.4 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  48.75 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
251 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1244  triosephosphate isomerase  46.43 
 
 
252 aa  231  6e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
251 aa  231  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  231  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 
253 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  48.4 
 
 
256 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 
256 aa  229  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  46 
 
 
251 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  49.61 
 
 
251 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 
256 aa  229  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  47.04 
 
 
253 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  48.41 
 
 
253 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  49 
 
 
246 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  45.97 
 
 
655 aa  228  1e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
250 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 
250 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 
256 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0103  triosephosphate isomerase  47.18 
 
 
256 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  47.62 
 
 
255 aa  226  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  47.93 
 
 
240 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  47.79 
 
 
253 aa  224  7e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  46.18 
 
 
251 aa  224  8e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
251 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 
251 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
255 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 
253 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 
246 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
253 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 
253 aa  223  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 
255 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  47.43 
 
 
255 aa  223  3e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  43.95 
 
 
250 aa  222  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  48.43 
 
 
251 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3808  triosephosphate isomerase  46.53 
 
 
255 aa  221  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102844  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  48 
 
 
248 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4717  Triose-phosphate isomerase  47.01 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000120949  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  47.11 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>