More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3253 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 756 aa  1494    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 742 aa  351  4e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 741 aa  346  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 784 aa  332  1e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  31.44 
 
 		 764 aa  325  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  30.17 
 
 		 798 aa  324  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.64 
 
 		 734 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 777 aa  317  6e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 772 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 762 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 740 aa  296  9e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 777 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 801 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  32.14 
 
 		 764 aa  293  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 679 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 781 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 		 705 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.82 
 
 		 764 aa  286  9e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 695 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 865 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 679 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 686 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 758 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 705 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 		 750 aa  283  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 753 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 756 aa  277  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 2539 aa  269  1e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 706 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  33.61 
 
 		 878 aa  268  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.33 
 
 		 769 aa  268  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 		 783 aa  266  7e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 		 777 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 808 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 755 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 896 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 896 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  40.99 
 
 		 799 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 1907 aa  258  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  29.74 
 
 		 764 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1012 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 2423 aa  257  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.08 
 
 		 763 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.09 
 
 		 768 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  34.37 
 
 		 839 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.06 
 
 		 789 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 1065 aa  255  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.9 
 
 		 2336 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.38 
 
 		 2476 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.58 
 
 		 2458 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  30.8 
 
 		 752 aa  253  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.19 
 
 		 1866 aa  252  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  29.94 
 
 		 1834 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 760 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 767 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  24.84 
 
 		 774 aa  249  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 1974 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.62 
 
 		 1971 aa  248  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.99 
 
 		 1960 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 1127 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 1758 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 808 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 762 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 765 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 1832 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  26.19 
 
 		 770 aa  244  5e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0505  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  33.83 
 
 		 2325 aa  243  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.806325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1427  CheA signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 1078 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.29605  normal  0.224222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  33.05 
 
 		 1987 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  32.48 
 
 		 2301 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.91 
 
 		 974 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 		 758 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 2212 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 804 aa  240  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 748 aa  240  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3779  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.76 
 
 		 1180 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274137 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 952 aa  239  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  32.65 
 
 		 2048 aa  238  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  24.4 
 
 		 769 aa  238  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 974 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  33.54 
 
 		 1989 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  28.96 
 
 		 2301 aa  237  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.76 
 
 		 864 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 1646 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  34.76 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  34.76 
 
 		 864 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0964  chemotaxis histidine kinase  34.76 
 
 		 1079 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  34.62 
 
 		 748 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 2414 aa  235  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 1647 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  29.8 
 
 		 785 aa  234  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 2164 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  27.11 
 
 		 770 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 706 aa  234  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 1725 aa  234  5e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>