More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3186 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1463  aspartyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
594 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0040271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3186  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
618 aa  1265    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.183634  normal  0.0997448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  52.03 
 
 
596 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000020223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
594 aa  647    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000312068  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2533  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
603 aa  678    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.465887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1322  aspartyl-tRNA synthetase  52.12 
 
 
593 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34967e-29 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1316  aspartyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
603 aa  676    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1329  aspartyl-tRNA synthetase  55.61 
 
 
616 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0519796  normal  0.185773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  52.88 
 
 
593 aa  636    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000200775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1418  aspartyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 
603 aa  676    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  51.78 
 
 
593 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000405553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
598 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000205655  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
627 aa  631  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0757  aspartyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
600 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000505912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2329  aspartyl-tRNA synthetase  51.11 
 
 
594 aa  629  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000245437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0012  aspartyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 
606 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00181386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3302  aspartyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 
613 aa  621  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0670  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
597 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000445499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1473  aspartyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 
592 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0686129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  51.03 
 
 
610 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4485  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
591 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0604234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4535  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
591 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000691465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1292  aspartyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
585 aa  611  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3118  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
589 aa  609  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00400953  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0714  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000343649  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4297  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.970735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4135  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
591 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00458828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4145  aspartyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 
591 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0128208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0150  aspartyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 
602 aa  606  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00425968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4632  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
591 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000004582  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4482  aspartyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
591 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31618e-21 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2506  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
594 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000273748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4522  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
591 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.010466  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 
592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2839  aspartyl-tRNA synthetase  50.68 
 
 
598 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 
590 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000646901  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0906  aspartyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 
601 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.401416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1331  aspartyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
595 aa  595  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.175841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
594 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0812  aspartyl-tRNA synthetase  49.66 
 
 
586 aa  595  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000270105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
599 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
599 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2038  aspartyl-tRNA synthetase  49.74 
 
 
614 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4249  aspartyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
591 aa  595  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00151202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2037  aspartyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 
600 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.439536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2350  aspartyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
619 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.613805  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
594 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000393733  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1484  aspartyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 
587 aa  589  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.04576e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0945  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
590 aa  587  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0442  aspartyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 
597 aa  586  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.967913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 
601 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2279  aspartyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
608 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000116393  hitchhiker  0.0000000131011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6101  aspartyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
578 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.692121  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1673  aspartyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1192  aspartyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
588 aa  579  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00103365  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0014  aspartyl-tRNA synthetase  50.34 
 
 
602 aa  580  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2053  aspartyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
584 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1946  aspartyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
593 aa  580  1e-164  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.734363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 
600 aa  581  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0634  aspartyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 
599 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000213965  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
592 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000069189  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2128  aspartyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
585 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00128349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
601 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2113  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
600 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19758  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
605 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 
600 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
600 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0553  aspartyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 
598 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0171157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0466  aspartyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
605 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0514  aspartyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0852  aspartyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.591723  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0356  aspartyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
623 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
599 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 
588 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 
599 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  48.41 
 
 
600 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
599 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15220  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
590 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.925983  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3981  aspartyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
591 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0111519  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1687  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
588 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000235097  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
600 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
600 aa  571  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
611 aa  570  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  48.98 
 
 
594 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000846052  decreased coverage  0.000000230652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
603 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1720  aspartyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
588 aa  570  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000219088  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
603 aa  570  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
623 aa  572  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 
591 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000271682  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0439  aspartyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
602 aa  566  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 
591 aa  565  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  49.49 
 
 
599 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000468378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>