More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3178 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
387 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.76 
 
 
528 aa  248  9e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.7 
 
 
365 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.19 
 
 
365 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  43.19 
 
 
365 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  49.11 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.14 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  45.51 
 
 
511 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  34.86 
 
 
520 aa  230  4e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.56 
 
 
698 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.78 
 
 
511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.46 
 
 
543 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  42.68 
 
 
542 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1079  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.56 
 
 
478 aa  203  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830119  normal  0.370782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  36.72 
 
 
845 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0865  glycoside hydrolase family 3 protein  44.6 
 
 
370 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.629227  normal  0.442993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.88 
 
 
382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.93 
 
 
534 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.93 
 
 
534 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  35.66 
 
 
633 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 
517 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2876  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  35.92 
 
 
363 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  39.09 
 
 
604 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  39.04 
 
 
673 aa  193  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  30.71 
 
 
528 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  40.92 
 
 
498 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  39.32 
 
 
543 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.11 
 
 
520 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  43.67 
 
 
538 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  34.73 
 
 
444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.07 
 
 
365 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  36.08 
 
 
503 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  37.66 
 
 
378 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  43.53 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 
976 aa  183  5.0000000000000004e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  38.02 
 
 
499 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.27 
 
 
543 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  42.76 
 
 
631 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.99 
 
 
600 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  46.32 
 
 
656 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.35 
 
 
552 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  39.15 
 
 
966 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  36.43 
 
 
361 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  44.64 
 
 
538 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  36.05 
 
 
344 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  37.18 
 
 
382 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  34.95 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.56 
 
 
558 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.82 
 
 
482 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.5 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.64 
 
 
398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  34.9 
 
 
374 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1990  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.16 
 
 
372 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.639682  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.79 
 
 
598 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  28.65 
 
 
531 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.66 
 
 
992 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.43 
 
 
343 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  37.95 
 
 
734 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2482  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.19 
 
 
341 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1003  glycoside hydrolase family 3 protein  38.54 
 
 
481 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.861392  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.35 
 
 
971 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.6 
 
 
375 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 
537 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.18 
 
 
395 aa  169  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  34.54 
 
 
585 aa  169  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  35.21 
 
 
997 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  36.64 
 
 
637 aa  169  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  35.08 
 
 
589 aa  169  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.42 
 
 
594 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.96 
 
 
490 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  36.31 
 
 
699 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  35.02 
 
 
688 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.82 
 
 
373 aa  168  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.54 
 
 
379 aa  168  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  37.63 
 
 
541 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.46 
 
 
990 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.65 
 
 
484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1327  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.79 
 
 
348 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0497854  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.77 
 
 
499 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  36.03 
 
 
699 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2180  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.24 
 
 
339 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259276  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 
346 aa  166  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  36.03 
 
 
699 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2069  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.739108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.78 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  39.35 
 
 
549 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3122  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.82 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.435185  normal  0.194122 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  37.45 
 
 
1003 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.58 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  38.75 
 
 
492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  35.75 
 
 
699 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2825  beta-hexosaminidase  39.58 
 
 
354 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.93 
 
 
596 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 
575 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.87 
 
 
568 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3398  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.26 
 
 
343 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.44 
 
 
580 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  40.22 
 
 
552 aa  162  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0727  beta-hexosaminidase  41.49 
 
 
359 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3707  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.99 
 
 
343 aa  162  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00367643  normal  0.692515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>