More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3112 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  100 
 
 		 343 aa  695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  55.98 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  55.98 
 
 		 347 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  55.69 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  55.85 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  55.13 
 
 		 341 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  55.69 
 
 		 347 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  55.75 
 
 		 344 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  56.18 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  54.87 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  55.88 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  53.53 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  54.57 
 
 		 344 aa  352  5e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  52.19 
 
 		 343 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  49.85 
 
 		 361 aa  344  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  54.57 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  53.64 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  52.92 
 
 		 345 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  52.34 
 
 		 345 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  53.6 
 
 		 345 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  52.92 
 
 		 345 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  52.45 
 
 		 353 aa  318  7e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  51.45 
 
 		 358 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  50.72 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  48.25 
 
 		 342 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  46.02 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  46.31 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  50 
 
 		 356 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  46.38 
 
 		 346 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  46.67 
 
 		 346 aa  258  8e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  42.44 
 
 		 342 aa  256  6e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  43.99 
 
 		 341 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  40.99 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  43.82 
 
 		 342 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  44.3 
 
 		 582 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  44.13 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  45.09 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  45.09 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  45.09 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  44.83 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  44.09 
 
 		 341 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  41.64 
 
 		 342 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  44.83 
 
 		 340 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  42.09 
 
 		 578 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  40.27 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  44.54 
 
 		 340 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  44.77 
 
 		 341 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  42.35 
 
 		 368 aa  235  9e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  45.29 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  42.31 
 
 		 577 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  39.45 
 
 		 337 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  44.83 
 
 		 340 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  43.77 
 
 		 341 aa  225  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  43.77 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  43.77 
 
 		 341 aa  225  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  35.56 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  43.77 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  43.77 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  43.9 
 
 		 340 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  40.66 
 
 		 340 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  39.94 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  43.6 
 
 		 340 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.73 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.73 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.73 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.73 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  44.58 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  42.43 
 
 		 340 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  41.86 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  41.86 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  42.61 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  42.14 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  34.95 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  37.39 
 
 		 407 aa  174  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  45.54 
 
 		 334 aa  159  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  39.01 
 
 		 346 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  30.28 
 
 		 322 aa  152  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  41.52 
 
 		 340 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  41.15 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0609  histone deacetylase superfamily  42.36 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  42.15 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  45.41 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  36.45 
 
 		 347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  35.55 
 
 		 438 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  38.73 
 
 		 451 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.09 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1746  histone deacetylase superfamily protein  33.12 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.115562 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1348  histone deacetylase superfamily protein  33.33 
 
 		 336 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.104059 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.06 
 
 		 380 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  43.26 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  33.49 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  36.95 
 
 		 528 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  37.29 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  35.29 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  38.67 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  42.13 
 
 		 446 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.72 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  48.13 
 
 		 342 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>