146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3078 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  100 
 
 		 602 aa  1182    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  44.94 
 
 		 1187 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  41.27 
 
 		 1207 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  44.07 
 
 		 941 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.98 
 
 		 535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.91 
 
 		 817 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40 
 
 		 787 aa  223  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  39 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 454 aa  204  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  39.45 
 
 		 778 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  40.94 
 
 		 792 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.19 
 
 		 837 aa  191  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  39.07 
 
 		 784 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  40.99 
 
 		 776 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  39.58 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  52.11 
 
 		 326 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  36.54 
 
 		 1147 aa  173  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.18 
 
 		 553 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  36.13 
 
 		 376 aa  150  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  38.92 
 
 		 389 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  35 
 
 		 449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  35.91 
 
 		 618 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.73 
 
 		 554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  34.44 
 
 		 593 aa  137  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.77 
 
 		 818 aa  136  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  36.34 
 
 		 551 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  35.05 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.16 
 
 		 821 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.92 
 
 		 1848 aa  127  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  35.03 
 
 		 553 aa  127  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  32.88 
 
 		 579 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  35.37 
 
 		 558 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.96 
 
 		 810 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.23 
 
 		 1919 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.87 
 
 		 561 aa  123  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.84 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2169  cysteine-rich repeat protein  43.66 
 
 		 378 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0145186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  29.75 
 
 		 577 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.92 
 
 		 556 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  33.81 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.54 
 
 		 555 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.12 
 
 		 555 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  32.26 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 2082 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  33.75 
 
 		 569 aa  113  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  39.47 
 
 		 681 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.23 
 
 		 417 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4804  cysteine-rich repeat protein  42.78 
 
 		 309 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0204235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  32.97 
 
 		 566 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.87 
 
 		 1679 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.33 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  29.76 
 
 		 911 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  30.31 
 
 		 558 aa  109  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  32.3 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.63 
 
 		 743 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.13 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  35.74 
 
 		 560 aa  108  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  31.17 
 
 		 714 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0930  cysteine-rich repeat protein  45.35 
 
 		 638 aa  107  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4979  cysteine-rich repeat protein  38.49 
 
 		 342 aa  106  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.73 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1332  cysteine-rich repeat protein  44.44 
 
 		 315 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.43 
 
 		 835 aa  105  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  32.17 
 
 		 900 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.9 
 
 		 363 aa  105  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0738  cysteine-rich repeat protein  44.77 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  29.05 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1094  cysteine-rich repeat protein  46.41 
 
 		 663 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.946471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.68 
 
 		 692 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.94 
 
 		 443 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2826  cysteine-rich repeat protein  42.77 
 
 		 645 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4805  cysteine-rich repeat protein  37.7 
 
 		 851 aa  97.8  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.115488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4803  cysteine-rich repeat protein  36.5 
 
 		 537 aa  96.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.130914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  28.92 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  28.34 
 
 		 575 aa  96.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 		 745 aa  95.9  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3827  cysteine-rich repeat protein  41.62 
 
 		 644 aa  95.9  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0509824  normal  0.0467523 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.3 
 
 		 737 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.72 
 
 		 706 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  28.71 
 
 		 717 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.21 
 
 		 643 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  28 
 
 		 807 aa  93.6  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.24 
 
 		 1222 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2527  cysteine-rich repeat protein  39.63 
 
 		 2055 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  28.49 
 
 		 461 aa  92  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0882  cysteine-rich repeat protein  40.21 
 
 		 420 aa  90.9  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  30.1 
 
 		 341 aa  90.9  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1193  cysteine-rich repeat protein  41.71 
 
 		 663 aa  90.5  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0206543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2085  cysteine-rich repeat protein  47.3 
 
 		 715 aa  90.5  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  28.82 
 
 		 1129 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  31.02 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  26.42 
 
 		 14609 aa  84  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  33.58 
 
 		 638 aa  82  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0573  cysteine-rich repeat protein  42.65 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.936742  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  40.5 
 
 		 133 aa  81.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.16 
 
 		 728 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  27.23 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  31.17 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.63 
 
 		 558 aa  74.7  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>