More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3015 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3015  ribosomal protein L24  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.252983  normal  0.454925 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000545325  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109018  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000177787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000111062  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000603774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000136575  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107051  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  52 
 
 		 107 aa  111  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  50.5 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  50.53 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  49.47 
 
 		 103 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000584056  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1158  50S ribosomal protein L24  49.51 
 
 		 104 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000530898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  47.37 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  49.48 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  46.32 
 
 		 102 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000719742  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 103 aa  108  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  48.45 
 
 		 103 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  44.66 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  49.04 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1150  ribosomal protein L24  47.52 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000301536  hitchhiker  0.000129525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  51 
 
 		 106 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1351  ribosomal protein L24  51.43 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 105 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000760345  unclonable  0.000000000281859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  48.98 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1303  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000135301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  47 
 
 		 107 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1383  50S ribosomal protein L24  50.52 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000287924  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0992  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.370569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 106 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000232797  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 105 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  44.55 
 
 		 109 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  47.42 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  46.39 
 
 		 102 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01280  ribosomal protein L24  46.39 
 
 		 104 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.67287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  49 
 
 		 105 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  48.98 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  48.98 
 
 		 104 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000108454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0433  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000268468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6038  50S ribosomal protein L24  48 
 
 		 108 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2449  50S ribosomal protein L24  46.88 
 
 		 108 aa  96.3  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 102 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  46 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0712  ribosomal protein L24  44 
 
 		 109 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000697674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2167  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.151202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  45 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0593  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 108 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  42.42 
 
 		 105 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0505  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0612161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3898  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00126984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  43 
 
 		 106 aa  93.6  9e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  46.39 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06360  50S ribosomal protein L24  43.14 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0848  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08960  50S ribosomal protein L24  44.12 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0786471  normal  0.0497722 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0444  50S ribosomal protein L24  49.5 
 
 		 105 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0162317  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2313  50S ribosomal protein L24  55.32 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000126749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  50.51 
 
 		 104 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0779  ribosomal protein L24  45.36 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0236  ribosomal protein L24  46.88 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04510  50S ribosomal protein L24  48.51 
 
 		 105 aa  92.4  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0040022  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0637  ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000000374833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4537  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407127  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  91.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  55.67 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  42 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000585684  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 104 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0465  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451517  hitchhiker  0.00000267089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0495  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  44 
 
 		 105 aa  90.1  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  43.27 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4738  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0127139  normal  0.762072 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  44.23 
 
 		 104 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1173  ribosomal protein L24  42 
 
 		 107 aa  90.1  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0344247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0498  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000033533  normal  0.098699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  41.41 
 
 		 104 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5068  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000162639  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  40.59 
 
 		 104 aa  90.1  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0186  50S ribosomal protein L24  45.83 
 
 		 115 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.401417 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0858  50S ribosomal protein L24P  45.16 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000339235  hitchhiker  0.000468877 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0462  50S ribosomal protein L24  41.58 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  45.19 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1734  50S ribosomal protein L24  40.95 
 
 		 110 aa  89  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_428  ribosomal protein L24  41.58 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1754  50S ribosomal protein L24  42.16 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.277856  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1856  50S ribosomal protein L24  40 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.368803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>