More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2971 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  36.24 
 
 
3711 aa  721    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 
7210 aa  1243    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.6 
 
 
1559 aa  829    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
3092 aa  725    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  36.45 
 
 
5255 aa  1263    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  36.72 
 
 
3033 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  37.8 
 
 
1584 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  43.72 
 
 
1087 aa  765    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.54 
 
 
1816 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  40.74 
 
 
2719 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.79 
 
 
3176 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  46.22 
 
 
3670 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  36.24 
 
 
2090 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  46.1 
 
 
2220 aa  673    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  46.27 
 
 
1337 aa  788    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.97 
 
 
950 aa  688    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  37.12 
 
 
1349 aa  763    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  39.1 
 
 
6768 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.84 
 
 
2551 aa  806    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
1874 aa  1101    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  47.92 
 
 
1656 aa  800    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  40.35 
 
 
1144 aa  769    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  46.37 
 
 
1587 aa  827    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  47.74 
 
 
2225 aa  767    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.33 
 
 
3494 aa  1286    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  44.64 
 
 
2126 aa  669    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  36.1 
 
 
1537 aa  717    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 
7279 aa  1317    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  35.06 
 
 
3130 aa  697    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  42.19 
 
 
3252 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.46 
 
 
1939 aa  880    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 
7110 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.03 
 
 
1349 aa  758    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.49 
 
 
5400 aa  1288    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  36.14 
 
 
1601 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.22 
 
 
3111 aa  766    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.63 
 
 
4165 aa  680    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  35.34 
 
 
1820 aa  688    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  37.95 
 
 
3645 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  44.79 
 
 
3408 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  43.79 
 
 
3099 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 
3693 aa  841    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  49.72 
 
 
2230 aa  820    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 
1520 aa  714    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 
1190 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  37.3 
 
 
1580 aa  728    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  46.18 
 
 
3045 aa  697    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 
1704 aa  653    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  39.61 
 
 
1602 aa  644    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  35.34 
 
 
2551 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 
1909 aa  945    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  42.92 
 
 
1354 aa  752    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37.43 
 
 
2880 aa  910    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5925  beta-ketoacyl synthase  35.67 
 
 
2644 aa  651    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 
3493 aa  772    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.9 
 
 
2462 aa  922    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.64 
 
 
4478 aa  835    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  39.16 
 
 
2604 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  44.62 
 
 
2333 aa  715    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  45.41 
 
 
1827 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  39.47 
 
 
3693 aa  841    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  38.97 
 
 
4080 aa  707    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 
1520 aa  714    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  43.81 
 
 
1190 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  37.3 
 
 
1580 aa  728    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.89 
 
 
1804 aa  731    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  33.87 
 
 
1704 aa  653    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  41.07 
 
 
3676 aa  864    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  45.51 
 
 
2477 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  40.03 
 
 
3696 aa  870    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.89 
 
 
3508 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  44.71 
 
 
1805 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  37.64 
 
 
1812 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.79 
 
 
1581 aa  745    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.98 
 
 
1966 aa  896    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.63 
 
 
1835 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.53 
 
 
3101 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.3 
 
 
3874 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  33.52 
 
 
1559 aa  827    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.04 
 
 
2762 aa  783    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 
5154 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  45.26 
 
 
2966 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  34.89 
 
 
1955 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.75 
 
 
1372 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  36.45 
 
 
2113 aa  726    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.45 
 
 
3702 aa  841    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  40.89 
 
 
4151 aa  675    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  43.59 
 
 
1190 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  37.1 
 
 
1580 aa  725    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.26 
 
 
4183 aa  827    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  33.81 
 
 
1704 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.91 
 
 
1832 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  50.48 
 
 
2890 aa  774    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  46.05 
 
 
3337 aa  690    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 
3679 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  48.48 
 
 
2232 aa  808    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  34.13 
 
 
4111 aa  1154    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 
1806 aa  660    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  37.28 
 
 
1822 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.19 
 
 
1577 aa  748    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>