43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2893 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 70 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  97.14 
 
 		 70 aa  133  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  95.71 
 
 		 70 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  91.18 
 
 		 80 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  71.43 
 
 		 70 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  61.43 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 79 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  52.17 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.28 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.28 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 348 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.3 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 255 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 263 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 263 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 327 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3276  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 281 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  37.74 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.18 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  37.74 
 
 		 225 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3598  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 281 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 90 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1971  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 112 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.910423 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>