More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2840 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  45.41 
 
 
215 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
210 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2811  Methyltransferase type 11  42.25 
 
 
204 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.481855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1091  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
187 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
209 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.5 
 
 
229 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  36 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  28 
 
 
198 aa  83.2  2e-15  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.33 
 
 
225 aa  81.3  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  39.39 
 
 
274 aa  80.1  2e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
305 aa  79  5e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.2 
 
 
228 aa  78.6  6e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.59 
 
 
229 aa  77  2e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  31.35 
 
 
208 aa  76.3  3e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
195 aa  74.7  1e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
506 aa  73.6  2e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.68 
 
 
211 aa  72.4  5e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04590  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.69 
 
 
210 aa  72  6e-12  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.886413  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.17 
 
 
254 aa  71.6  7e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
252 aa  71.2  9e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.1 
 
 
287 aa  71.2  9e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.23 
 
 
204 aa  70.5  2e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.23 
 
 
204 aa  70.5  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
215 aa  70.5  2e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
247 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
212 aa  69.7  3e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.45 
 
 
217 aa  69.3  4e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  37.68 
 
 
239 aa  68.6  6e-11  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.5 
 
 
204 aa  68.6  7e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.23 
 
 
212 aa  68.2  9e-11  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
201 aa  67.4  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 
205 aa  67.8  1e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
201 aa  67.8  1e-10  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.23 
 
 
212 aa  68.2  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
266 aa  67.8  1e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  31.51 
 
 
242 aa  67.4  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.17184e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  35.21 
 
 
270 aa  67.4  1e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  31.62 
 
 
420 aa  67.8  1e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
225 aa  67.8  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  25.6 
 
 
211 aa  67.8  1e-10  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4321  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.9 
 
 
208 aa  67.4  2e-10  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701577  normal  0.237369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.59 
 
 
212 aa  67  2e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  5.91406e-06 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.99 
 
 
238 aa  66.6  2e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
262 aa  67.4  2e-10  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
310 aa  67.4  2e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.03 
 
 
269 aa  66.2  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.88 
 
 
261 aa  66.2  3e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
309 aa  66.2  3e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.59 
 
 
212 aa  66.6  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.3 
 
 
229 aa  66.2  3e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.41 
 
 
216 aa  65.9  4e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
330 aa  66.2  4e-10  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
201 aa  65.9  5e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  44.33 
 
 
243 aa  65.9  5e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  32.19 
 
 
251 aa  65.5  5e-10  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
275 aa  65.5  5e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27 
 
 
200 aa  65.5  6e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 
272 aa  65.1  6e-10  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.61 
 
 
212 aa  65.1  6e-10  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  43.01 
 
 
255 aa  65.1  7e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 
257 aa  65.1  8e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  40.78 
 
 
220 aa  64.3  1e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
261 aa  64.3  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.34 
 
 
217 aa  63.9  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  33.33 
 
 
261 aa  64.3  1e-09  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.14 
 
 
200 aa  63.9  1e-09  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.03 
 
 
199 aa  63.9  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.09 
 
 
265 aa  64.7  1e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.31 
 
 
255 aa  64.3  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  27 
 
 
200 aa  63.5  2e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2996  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 
254 aa  63.5  2e-09  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
278 aa  63.5  2e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.61 
 
 
212 aa  63.5  2e-09  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2017  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  31.94 
 
 
248 aa  63.9  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1918  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
229 aa  63.2  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.45 
 
 
268 aa  63.9  2e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.25 
 
 
305 aa  63.9  2e-09  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
349 aa  63.2  3e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
278 aa  62.8  4e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  31.41 
 
 
255 aa  62.8  4e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.77 
 
 
217 aa  62.4  4e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
278 aa  62.8  4e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
217 aa  62.4  5e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
226 aa  62.4  5e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  38.3 
 
 
266 aa  62.4  5e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
291 aa  62  5e-09  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.46 
 
 
212 aa  62  5e-09  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  37.96 
 
 
258 aa  62  7e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.62 
 
 
221 aa  61.6  7e-09  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
279 aa  61.6  8e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.05 
 
 
226 aa  61.6  8e-09  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
279 aa  61.6  8e-09  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  42.42 
 
 
255 aa  61.6  9e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
269 aa  61.6  9e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 
251 aa  61.2  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4057  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 
251 aa  61.2  1e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.51 
 
 
251 aa  61.2  1e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  38.18 
 
 
250 aa  61.2  1e-08  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.78 
 
 
251 aa  61.2  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>