221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2771 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2771  Peptidase M23  100 
 
 		 225 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000396333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  41.98 
 
 		 440 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000802583  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  41.98 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0853  exported peptidase  45.68 
 
 		 446 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.141822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  38.27 
 
 		 441 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  30.82 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3437  Peptidase M23  34.03 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.112257  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2495  Peptidase M23  38.3 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.81 
 
 		 442 aa  53.1  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2250  hypothetical protein  38.27 
 
 		 470 aa  53.1  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0038093  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  40.74 
 
 		 430 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  38.27 
 
 		 419 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1772  M23/M37 familypeptidase  43.53 
 
 		 327 aa  52.8  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  38.27 
 
 		 440 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  37.04 
 
 		 486 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  34.88 
 
 		 395 aa  52.4  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  41.77 
 
 		 439 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.89 
 
 		 313 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  38.27 
 
 		 439 aa  52  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000232327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  40.24 
 
 		 325 aa  51.6  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.05 
 
 		 421 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  37.25 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  38.38 
 
 		 438 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  41.38 
 
 		 418 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  37.5 
 
 		 390 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  38.38 
 
 		 410 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000144361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  39.51 
 
 		 527 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  38.38 
 
 		 438 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148125  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  35.05 
 
 		 424 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  39.24 
 
 		 428 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  36.08 
 
 		 424 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  35.05 
 
 		 423 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  35.05 
 
 		 417 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  35.05 
 
 		 423 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  35.05 
 
 		 423 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  35.05 
 
 		 417 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  35.05 
 
 		 423 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  35.05 
 
 		 423 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  39.13 
 
 		 271 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  35.29 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.47 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.24 
 
 		 457 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  37.37 
 
 		 524 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  39.56 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  46.27 
 
 		 323 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1389  M24/M37 family peptidase  38.96 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000798303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1500  M23/37 family peptidase  38.96 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000118576  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  34.51 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  31.06 
 
 		 402 aa  49.3  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  34 
 
 		 464 aa  48.9  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  32.58 
 
 		 571 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  36.08 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0622  peptidase M23B  34.56 
 
 		 280 aa  48.9  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  39.24 
 
 		 453 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  36.9 
 
 		 454 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  36.9 
 
 		 454 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0732  peptidase M23B  36.62 
 
 		 406 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  36.08 
 
 		 414 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.71 
 
 		 452 aa  48.5  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  46.27 
 
 		 438 aa  48.5  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1572  Peptidase M23  38.36 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.84 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  40.48 
 
 		 347 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  34 
 
 		 474 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  33 
 
 		 478 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  39.74 
 
 		 367 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  40 
 
 		 602 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  41.11 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.84 
 
 		 447 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  34.69 
 
 		 471 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.02 
 
 		 323 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  35.44 
 
 		 332 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  40 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33 
 
 		 449 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  35.37 
 
 		 458 aa  47.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4508  Peptidase M23  36.46 
 
 		 392 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40.51 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  29 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  28.47 
 
 		 484 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1534  peptidase, M23/M37 family  37.66 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  38.37 
 
 		 349 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  37.37 
 
 		 687 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3811  peptidase, M23/M37 family  37.66 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000746797  unclonable  9.38185e-26 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  34.83 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19390  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.05 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  36.36 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>