More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2751 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  55.91 
 
 
534 aa  640    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  57.12 
 
 
546 aa  643    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  63.57 
 
 
536 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  58.32 
 
 
542 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  63 
 
 
533 aa  680    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  58.13 
 
 
542 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2513  CTP synthetase  59.03 
 
 
552 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.294945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  62.17 
 
 
547 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  57.93 
 
 
543 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.5 
 
 
545 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  62.86 
 
 
555 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  56.36 
 
 
531 aa  642    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  59.07 
 
 
543 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  62.59 
 
 
534 aa  702    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  56.27 
 
 
554 aa  639    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  59.6 
 
 
549 aa  651    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0156  CTP synthetase  58.55 
 
 
546 aa  656    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  62.73 
 
 
538 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1765  CTP synthetase  56.69 
 
 
548 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.279833  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  58.2 
 
 
543 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  60.37 
 
 
547 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  55.89 
 
 
538 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  59.01 
 
 
537 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  62.86 
 
 
555 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  57.5 
 
 
547 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  58.66 
 
 
542 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1511  CTP synthetase  57.09 
 
 
547 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174656  decreased coverage  0.000112124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  57.78 
 
 
541 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  57.92 
 
 
535 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  56.27 
 
 
542 aa  636    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  56.98 
 
 
558 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  57.87 
 
 
531 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  58.32 
 
 
542 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  61.59 
 
 
555 aa  693    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  56.58 
 
 
539 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0157  CTP synthetase  58.22 
 
 
539 aa  644    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.337203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  57.31 
 
 
547 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  63.04 
 
 
555 aa  700    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  100 
 
 
555 aa  1133    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0071  CTP synthase  57.77 
 
 
559 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.22 
 
 
542 aa  647    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  61.86 
 
 
534 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  59.48 
 
 
553 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  62.81 
 
 
533 aa  677    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  58.37 
 
 
533 aa  647    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  60.34 
 
 
540 aa  639    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  57.43 
 
 
550 aa  655    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  63.75 
 
 
557 aa  712    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  62.76 
 
 
535 aa  673    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  59.23 
 
 
543 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  59.12 
 
 
555 aa  648    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  61.42 
 
 
535 aa  678    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  57.95 
 
 
557 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.1 
 
 
530 aa  633  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  57.94 
 
 
542 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.31 
 
 
545 aa  632  1e-180  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1151  CTP synthetase  53.82 
 
 
554 aa  632  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.485284  normal  0.0237518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1557  CTP synthetase  57.8 
 
 
547 aa  633  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.591143  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0975  CTP synthetase  57.54 
 
 
547 aa  631  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1734  CTP synthetase  55.93 
 
 
535 aa  629  1e-179  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0461926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  57.03 
 
 
533 aa  628  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0619  CTP synthetase  58.66 
 
 
546 aa  629  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.626167  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  57.95 
 
 
555 aa  630  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  56.42 
 
 
533 aa  628  1e-179  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  57.67 
 
 
542 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  57.67 
 
 
542 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  57.49 
 
 
545 aa  625  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  56.39 
 
 
534 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  58.32 
 
 
543 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1190  CTP synthetase  57.56 
 
 
545 aa  626  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  58.32 
 
 
543 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2383  CTP synthetase  55.47 
 
 
537 aa  628  1e-178  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.508995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  58.04 
 
 
544 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0617  CTP synthetase  58.46 
 
 
548 aa  627  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.77 
 
 
537 aa  627  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  59.07 
 
 
540 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  57.57 
 
 
542 aa  628  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  57.87 
 
 
550 aa  625  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.23 
 
 
533 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1184  CTP synthetase  57.56 
 
 
545 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  57.73 
 
 
546 aa  624  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.53 
 
 
533 aa  623  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  55.98 
 
 
546 aa  622  1e-177  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  56.17 
 
 
532 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.73 
 
 
551 aa  623  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  55.85 
 
 
533 aa  623  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2712  CTP synthase  57.88 
 
 
563 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1743  CTP synthetase  57.58 
 
 
547 aa  619  1e-176  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0432346  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2201  CTP synthetase  54.39 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  54.46 
 
 
535 aa  618  1e-176  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  54.46 
 
 
535 aa  618  1e-176  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  58.13 
 
 
555 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1291  CTP synthetase  54.94 
 
 
555 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  54.97 
 
 
534 aa  618  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2598  CTP synthetase  54.96 
 
 
549 aa  620  1e-176  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0553655  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  54.46 
 
 
535 aa  618  1e-176  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2163  CTP synthetase  54.39 
 
 
536 aa  620  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1243  CTP synthetase  56.72 
 
 
543 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.381709  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  54.33 
 
 
558 aa  619  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  57.22 
 
 
536 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>