More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2705 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  66.1 
 
 
555 aa  706    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  100 
 
 
528 aa  1051    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  66.92 
 
 
554 aa  690    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  66.92 
 
 
554 aa  691    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  66.92 
 
 
554 aa  691    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  59.81 
 
 
548 aa  628  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  56.17 
 
 
544 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  56.81 
 
 
535 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  56.64 
 
 
552 aa  597  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  57.31 
 
 
558 aa  596  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  57.39 
 
 
545 aa  588  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.86 
 
 
554 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  56.44 
 
 
565 aa  580  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  56.14 
 
 
564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  53.06 
 
 
556 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  53.67 
 
 
542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.04 
 
 
563 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  53.32 
 
 
563 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.94 
 
 
563 aa  558  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  53.74 
 
 
540 aa  559  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  56.3 
 
 
557 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  53.9 
 
 
565 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  51.91 
 
 
558 aa  533  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  55.68 
 
 
554 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  53.1 
 
 
541 aa  529  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  52.14 
 
 
541 aa  530  1e-149  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  51.92 
 
 
541 aa  525  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  50.87 
 
 
539 aa  523  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  50.95 
 
 
558 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  51.95 
 
 
541 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  49.23 
 
 
539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  55.22 
 
 
555 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  55.22 
 
 
555 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  51.84 
 
 
543 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  50.39 
 
 
542 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  50.48 
 
 
543 aa  498  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  43.68 
 
 
587 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.44 
 
 
548 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  43.24 
 
 
560 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  42.26 
 
 
590 aa  409  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  42.18 
 
 
564 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  43.66 
 
 
559 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  40.38 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  40.19 
 
 
541 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  40.57 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  42.8 
 
 
796 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  41.9 
 
 
553 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  39.54 
 
 
539 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  40.85 
 
 
541 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  41.37 
 
 
615 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0177  cytochrome c oxidase, subunit I  41.18 
 
 
540 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  41.73 
 
 
661 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  42.15 
 
 
575 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.13 
 
 
641 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  41.12 
 
 
536 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  40.89 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  43.21 
 
 
806 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 
641 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4607  cytochrome c oxidase, subunit I  42 
 
 
530 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  41.25 
 
 
555 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  41.91 
 
 
555 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  41.91 
 
 
555 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  41.49 
 
 
518 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0197  cytochrome-c oxidase  41.81 
 
 
534 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3792  cytochrome-c oxidase  42 
 
 
530 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 
743 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4000  cytochrome c oxidase subunit I type  41.86 
 
 
534 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  40.23 
 
 
546 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0153  cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 
530 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4312  cytochrome c oxidase, subunit I  41.41 
 
 
530 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3865  cytochrome-c oxidase  41.81 
 
 
530 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4181  cytochrome c oxidase subunit I type  41.41 
 
 
530 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3992  cytochrome c oxidase, subunit I  41.81 
 
 
530 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  40.23 
 
 
546 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4113  cytochrome c oxidase, subunit I  41.41 
 
 
531 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  39.96 
 
 
516 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  39.05 
 
 
552 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3484  cytochrome-c oxidase  41.21 
 
 
531 aa  392  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3783  cytochrome-c oxidase  41.41 
 
 
530 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  39.39 
 
 
558 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  40.88 
 
 
562 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0257  cytochrome-c oxidase  41.27 
 
 
531 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  40.64 
 
 
638 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  39.92 
 
 
559 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  39.81 
 
 
555 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01300  cytochrome c oxidase, subunit I  41.02 
 
 
530 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324911  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  41.33 
 
 
879 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  39.34 
 
 
565 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0078  cytochrome-c oxidase  40.08 
 
 
530 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  38.74 
 
 
556 aa  383  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  39.92 
 
 
554 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  41.14 
 
 
566 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3518  cytochrome-c oxidase  40.31 
 
 
535 aa  385  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  41.33 
 
 
1004 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0181  cytochrome c oxidase subunit I  40.82 
 
 
530 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  41.33 
 
 
879 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  41.52 
 
 
882 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  41.33 
 
 
879 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01010  cytochrome c oxidase, subunit I  40.04 
 
 
530 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113343  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  39.42 
 
 
519 aa  379  1e-104  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>