More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2586 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  50 
 
 		 887 aa  758    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  52.05 
 
 		 874 aa  784    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 924 aa  1857    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  39.14 
 
 		 947 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  39.35 
 
 		 924 aa  525  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  34.93 
 
 		 918 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 817 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  38.04 
 
 		 797 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 797 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 797 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.91 
 
 		 797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  36.17 
 
 		 933 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  37 
 
 		 812 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 803 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 812 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 812 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  36.69 
 
 		 797 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.79 
 
 		 843 aa  415  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 850 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.03 
 
 		 853 aa  393  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 853 aa  386  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  32.13 
 
 		 987 aa  383  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 948 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  35.5 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 817 aa  360  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  33.02 
 
 		 870 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  31.99 
 
 		 848 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.79 
 
 		 811 aa  356  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  34.74 
 
 		 803 aa  354  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 811 aa  354  5e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  30.96 
 
 		 847 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.21 
 
 		 784 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.75 
 
 		 840 aa  347  5e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.08 
 
 		 795 aa  337  7e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  32.83 
 
 		 788 aa  335  2e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 788 aa  331  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.29 
 
 		 800 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 800 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 795 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 835 aa  316  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  34.75 
 
 		 811 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  34.24 
 
 		 884 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.31 
 
 		 832 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.08 
 
 		 961 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  31.39 
 
 		 871 aa  306  9.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 815 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 793 aa  303  1e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.05 
 
 		 821 aa  301  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.81 
 
 		 793 aa  300  6e-80  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 883 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  32.19 
 
 		 823 aa  293  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 847 aa  290  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.77 
 
 		 856 aa  287  5.999999999999999e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.19 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  30.98 
 
 		 864 aa  285  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  30.46 
 
 		 816 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.62 
 
 		 842 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 868 aa  280  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.21 
 
 		 867 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 804 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 851 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 833 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 849 aa  271  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.25 
 
 		 818 aa  267  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 867 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  32.7 
 
 		 948 aa  262  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 867 aa  262  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 858 aa  260  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 857 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 800 aa  252  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 815 aa  234  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 		 842 aa  230  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 885 aa  228  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 872 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 858 aa  220  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 813 aa  217  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 879 aa  209  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 873 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 852 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.96 
 
 		 1015 aa  187  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 869 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 870 aa  152  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 838 aa  118  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  37.83 
 
 		 855 aa  101  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  42.94 
 
 		 709 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 861 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 849 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  41.72 
 
 		 871 aa  99.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  36.91 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 855 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 861 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 861 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  42.6 
 
 		 853 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2967  TonB-dependent receptor  36.96 
 
 		 857 aa  100  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000174041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  42.5 
 
 		 852 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 861 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  36.52 
 
 		 861 aa  99.4  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  43.87 
 
 		 875 aa  98.6  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>