More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2541 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
646 aa  1322    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.94 
 
 
1376 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.87 
 
 
588 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.92 
 
 
607 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.4 
 
 
602 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.68 
 
 
590 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.11 
 
 
630 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.47 
 
 
590 aa  363  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.61 
 
 
716 aa  362  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.44 
 
 
556 aa  343  8e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.64 
 
 
552 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.37 
 
 
563 aa  327  5e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.15 
 
 
708 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.92 
 
 
728 aa  317  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.66 
 
 
568 aa  316  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
602 aa  313  4.999999999999999e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  45.7 
 
 
705 aa  312  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  45.7 
 
 
705 aa  312  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.4 
 
 
705 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.29 
 
 
706 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 
705 aa  310  5e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.16 
 
 
707 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.75 
 
 
626 aa  310  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.4 
 
 
705 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  47.26 
 
 
597 aa  309  9e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.33 
 
 
793 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.12 
 
 
545 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.98 
 
 
617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 
594 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.14 
 
 
615 aa  298  3e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.88 
 
 
535 aa  296  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.15 
 
 
562 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.16 
 
 
620 aa  294  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  44.44 
 
 
724 aa  294  4e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.03 
 
 
593 aa  294  4e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.14 
 
 
681 aa  293  7e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
592 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0825  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.29 
 
 
598 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2051  superfamily II DNA/RNA helicase  42.57 
 
 
637 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000195113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.9 
 
 
705 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.21 
 
 
617 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 
624 aa  291  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 
724 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.22 
 
 
721 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.77 
 
 
714 aa  290  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 
593 aa  290  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.26 
 
 
601 aa  290  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 
593 aa  290  7e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  41.99 
 
 
679 aa  290  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.48 
 
 
611 aa  290  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  44.38 
 
 
621 aa  289  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
603 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.72 
 
 
592 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
625 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.02 
 
 
602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.29 
 
 
497 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
611 aa  287  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3780  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.56 
 
 
642 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
607 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.09 
 
 
681 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.31 
 
 
607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4553  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.95 
 
 
864 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.08 
 
 
709 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 
607 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 
711 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
607 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.21 
 
 
607 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.22 
 
 
602 aa  283  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.78 
 
 
615 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.08 
 
 
709 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 
712 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.46 
 
 
608 aa  282  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.06 
 
 
710 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  43.52 
 
 
690 aa  282  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.37 
 
 
599 aa  281  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.25 
 
 
634 aa  282  2e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.36 
 
 
610 aa  281  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
599 aa  281  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.25 
 
 
674 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.15 
 
 
619 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
707 aa  280  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 
641 aa  280  7e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000407323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.43 
 
 
607 aa  279  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.7 
 
 
615 aa  279  1e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.5 
 
 
596 aa  279  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.15 
 
 
662 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 
607 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.15 
 
 
662 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.75 
 
 
606 aa  277  3e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.69 
 
 
659 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>