166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2534 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2534  protein of unknown function DUF427  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4022  hypothetical protein  64.47 
 
 
165 aa  208  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3776  hypothetical protein  63.82 
 
 
165 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0718949  normal  0.0555317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1318  hypothetical protein  63.82 
 
 
162 aa  201  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1748  protein of unknown function DUF427  61.84 
 
 
163 aa  197  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0012461  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5019  protein of unknown function DUF427  57.89 
 
 
166 aa  193  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.733817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1298  hypothetical protein  59.21 
 
 
165 aa  191  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1654  hypothetical protein  59.21 
 
 
165 aa  188  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.026599  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3074  protein of unknown function DUF427  56.58 
 
 
164 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.672285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1190  hypothetical protein  55.26 
 
 
164 aa  181  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880382  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5492  hypothetical protein  57.89 
 
 
169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2211  hypothetical protein  53.8 
 
 
158 aa  177  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4864  protein of unknown function DUF427  56.58 
 
 
164 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0246327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3161  hypothetical protein  56.58 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.636241  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2069  protein of unknown function DUF427  52.63 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2093  protein of unknown function DUF427  52.63 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4401  hypothetical protein  55.92 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.528478  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4910  protein of unknown function DUF427  55.26 
 
 
164 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186738  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0902  protein of unknown function DUF427  52.63 
 
 
166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.336463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0094  hypothetical protein  50 
 
 
166 aa  161  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.569899  normal  0.716985 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2022  hypothetical protein  51.32 
 
 
175 aa  161  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3615  hypothetical protein  52.26 
 
 
156 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1369  protein of unknown function DUF427  53.29 
 
 
165 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3005  hypothetical protein  51.32 
 
 
166 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2990  hypothetical protein  50.66 
 
 
166 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3034  hypothetical protein  50.66 
 
 
166 aa  154  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3793  hypothetical protein  51.32 
 
 
163 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0482491  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3412  hypothetical protein  47.37 
 
 
164 aa  152  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.946103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2745  hypothetical protein  50.66 
 
 
163 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390999  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10361  hypothetical protein  49.01 
 
 
156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4011  protein of unknown function DUF427  49.69 
 
 
160 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.425997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2920  protein of unknown function DUF427  47.8 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000166616  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1034  hypothetical protein  45.33 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0173454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0497  protein of unknown function DUF427  46.2 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166154 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1757  hypothetical protein  42.67 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.860278  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2271  hypothetical protein  41.96 
 
 
270 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000495409  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0354  protein of unknown function DUF427  45.36 
 
 
118 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347186  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0310  hypothetical protein  44.33 
 
 
118 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1593  hypothetical protein  42.71 
 
 
121 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.337272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2689  protein of unknown function DUF427  37.4 
 
 
132 aa  87.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.163482  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2947  protein of unknown function DUF427  37.4 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.30494  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4812  hypothetical protein  40.82 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000741857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1711  protein of unknown function DUF427  39.8 
 
 
121 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212049  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11074  hypothetical protein  38.71 
 
 
254 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0277375  normal  0.0429341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0283  hypothetical protein  41.12 
 
 
274 aa  81.6  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0703  hypothetical protein  40.21 
 
 
130 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2621  hypothetical protein  36.94 
 
 
125 aa  79  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3263  protein of unknown function DUF427  38.14 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187947  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3922  hypothetical protein  40.82 
 
 
135 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00699821  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4538  protein of unknown function DUF427  35.38 
 
 
249 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3999  hypothetical protein  40.21 
 
 
125 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2185  protein of unknown function DUF427  40.38 
 
 
264 aa  77  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.485645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1714  domain of unknown function  37.84 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2835  protein of unknown function DUF427  37.04 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.101428  hitchhiker  0.00437748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3415  hypothetical protein  40.82 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.538034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2252  hypothetical protein  42.27 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2678  hypothetical protein  40 
 
 
120 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.118141  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4771  hypothetical protein  37.38 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.527495  normal  0.539362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3711  hypothetical protein  38.54 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224124  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3697  hypothetical protein  34.45 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391658  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4352  hypothetical protein  38.78 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2068  hypothetical protein  39.8 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592398  normal  0.804592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1300  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.477108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0386  protein of unknown function DUF427  41.24 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.890427  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0235  hypothetical protein  40.62 
 
 
118 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1788  protein of unknown function DUF427  38.95 
 
 
120 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5702  hypothetical protein  40 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2618  hypothetical protein  35.05 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.228349  normal  0.0222891 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0092  protein of unknown function DUF427  36.79 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0086  protein of unknown function DUF427  36.79 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4569  hypothetical protein  38.78 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289921  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3666  hypothetical protein  38.24 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0993612 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4720  hypothetical protein  32.82 
 
 
258 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.593041  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2722  hypothetical protein  37.08 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.696905  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10141  hypothetical protein  34.86 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0111  hypothetical protein  47.76 
 
 
93 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.733317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5398  hypothetical protein  34.95 
 
 
120 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477933  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2287  hypothetical protein  38.39 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1754  hypothetical protein  35.42 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1793  protein of unknown function DUF427  31.82 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5084  hypothetical protein  34.02 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.366298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5172  hypothetical protein  34.02 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1049  hypothetical protein  38.39 
 
 
241 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0963  hypothetical protein  38.39 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.260963  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1110  hypothetical protein  38.64 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5462  hypothetical protein  34.02 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3361  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3721  hypothetical protein  36.08 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0946266  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0690  protein of unknown function DUF427  33 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.822269  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0373  hypothetical protein  34.31 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3509  hypothetical protein  39.53 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214486 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4351  hypothetical protein  39.53 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.798162  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4015  hypothetical protein  39.53 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718137  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13333  hypothetical protein  31.18 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.430926  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1748  hypothetical protein  32.98 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.803353  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0684  hypothetical protein  35.19 
 
 
119 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.835024  normal  0.563899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5945  hypothetical protein  35.19 
 
 
119 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2744  hypothetical protein  32.22 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0532272  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0175  protein of unknown function DUF427  34.82 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1675  protein of unknown function DUF427  32.71 
 
 
124 aa  62  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>