More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2519 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  100 
 
 
389 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  56.81 
 
 
394 aa  425  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  53.95 
 
 
386 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  56.17 
 
 
382 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  57.66 
 
 
397 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  56.62 
 
 
387 aa  401  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  56.62 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  53.14 
 
 
391 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  52.79 
 
 
385 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  53.32 
 
 
395 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  53 
 
 
387 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  54.01 
 
 
387 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
387 aa  378  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  53.68 
 
 
381 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  51.52 
 
 
397 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 
393 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  52.15 
 
 
383 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  53.49 
 
 
397 aa  361  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  50.39 
 
 
395 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
413 aa  359  4e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  50.39 
 
 
391 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  50.66 
 
 
388 aa  355  8.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  52.29 
 
 
384 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  49.22 
 
 
391 aa  354  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  50 
 
 
395 aa  353  2e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  49.34 
 
 
384 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  50.52 
 
 
400 aa  348  7e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  49.87 
 
 
409 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  49.87 
 
 
402 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  51.62 
 
 
394 aa  346  4e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  50.54 
 
 
383 aa  346  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 
401 aa  345  8e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  49.48 
 
 
389 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  48.81 
 
 
392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  50.52 
 
 
394 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  47.15 
 
 
384 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.91 
 
 
387 aa  338  7e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  47.23 
 
 
389 aa  338  7e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  50.52 
 
 
394 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  50.51 
 
 
397 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  50 
 
 
389 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  50 
 
 
389 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  47.04 
 
 
388 aa  333  3e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  50.66 
 
 
413 aa  333  3e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  45.97 
 
 
421 aa  333  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  45.53 
 
 
387 aa  332  6e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  44.99 
 
 
384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  42.27 
 
 
393 aa  325  1e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  43.9 
 
 
385 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  52 
 
 
402 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  47.51 
 
 
394 aa  323  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  44.17 
 
 
384 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  48.24 
 
 
384 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  47.24 
 
 
409 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  43.73 
 
 
405 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  47.45 
 
 
383 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
421 aa  317  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4557  hypothetical protein  48.92 
 
 
398 aa  317  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  43.39 
 
 
385 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  42.59 
 
 
385 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  43.8 
 
 
379 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  43.12 
 
 
385 aa  311  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  44.04 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  45.58 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  46.95 
 
 
408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  41.8 
 
 
386 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  41.8 
 
 
386 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  40.36 
 
 
390 aa  302  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  39.11 
 
 
393 aa  301  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  43.12 
 
 
382 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  42.37 
 
 
382 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  41.53 
 
 
385 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  41.84 
 
 
382 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0941  putative aminotransferase  41.01 
 
 
386 aa  301  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.922283  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  44.09 
 
 
382 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  41.27 
 
 
386 aa  299  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  43.39 
 
 
382 aa  298  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  43.8 
 
 
417 aa  298  1e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.9 
 
 
382 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  43.39 
 
 
390 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  43.12 
 
 
399 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  42.86 
 
 
382 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0642  putative aminotransferase  41.6 
 
 
389 aa  295  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0700  putative aminotransferase  41.6 
 
 
386 aa  295  9e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.330763  normal  0.0611004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  42.33 
 
 
390 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0656  putative aminotransferase  41.6 
 
 
389 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0715  putative aminotransferase  41.6 
 
 
386 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  40.05 
 
 
400 aa  293  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  41.49 
 
 
386 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0761  putative aminotransferase  41.6 
 
 
386 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.405415  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  42.15 
 
 
383 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  39.79 
 
 
386 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  39.79 
 
 
386 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  42.15 
 
 
383 aa  293  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0852  aminotransferase class I and II  41.13 
 
 
384 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  41.53 
 
 
382 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0220  aminotransferase class I and II  42.74 
 
 
385 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  39.79 
 
 
386 aa  291  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1088  putative aminotransferase  43.12 
 
 
390 aa  291  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214876  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  39.79 
 
 
386 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>