More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2472 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 605 aa  1179    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  38.33 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.81 
 
 		 574 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  38.96 
 
 		 554 aa  363  6e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.97 
 
 		 556 aa  357  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 553 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.89 
 
 		 556 aa  349  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.7 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.02 
 
 		 577 aa  347  5e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.44 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  33.88 
 
 		 566 aa  345  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  34.44 
 
 		 565 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 560 aa  343  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  39.34 
 
 		 553 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  42.3 
 
 		 611 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 570 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 572 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.66 
 
 		 573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  34.68 
 
 		 580 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  40.86 
 
 		 606 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  40.96 
 
 		 606 aa  334  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  36.59 
 
 		 560 aa  333  7.000000000000001e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  41.29 
 
 		 606 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 562 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.09 
 
 		 559 aa  330  7e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  37.69 
 
 		 564 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  32.33 
 
 		 556 aa  326  9e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  32.61 
 
 		 608 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.39 
 
 		 579 aa  323  8e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  36.32 
 
 		 554 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  34.12 
 
 		 554 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  35.05 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  32.89 
 
 		 565 aa  320  5e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 553 aa  320  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  38 
 
 		 567 aa  320  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 553 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  35.05 
 
 		 553 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.23 
 
 		 579 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  35.38 
 
 		 553 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  33.23 
 
 		 579 aa  319  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  35.05 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  34.88 
 
 		 553 aa  318  2e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  33.89 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  34.88 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.01 
 
 		 579 aa  317  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  37.5 
 
 		 553 aa  316  9e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  36.2 
 
 		 572 aa  316  9e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  32.85 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  32.85 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  32.61 
 
 		 555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 554 aa  314  3.9999999999999997e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  32.69 
 
 		 579 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  35.14 
 
 		 586 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  34.94 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  35.68 
 
 		 559 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  34.61 
 
 		 557 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  34.72 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  33 
 
 		 556 aa  307  5.0000000000000004e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  32.28 
 
 		 567 aa  306  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  33.83 
 
 		 565 aa  306  7e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  33.33 
 
 		 557 aa  306  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  31.09 
 
 		 557 aa  306  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  33.61 
 
 		 552 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 553 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.55 
 
 		 553 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  32.43 
 
 		 579 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 557 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.78 
 
 		 553 aa  302  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  31.26 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  32.66 
 
 		 552 aa  301  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.89 
 
 		 555 aa  301  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.77 
 
 		 553 aa  300  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  33.22 
 
 		 553 aa  300  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  32.11 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  33.98 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.72 
 
 		 554 aa  299  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.17 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.17 
 
 		 561 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  38.86 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  38.86 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  36.27 
 
 		 589 aa  296  6e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.96 
 
 		 558 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.75 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  33.39 
 
 		 554 aa  295  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3082  DNA repair protein RecN  39.31 
 
 		 556 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.19 
 
 		 599 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  31.1 
 
 		 588 aa  293  8e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.06 
 
 		 556 aa  293  9e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  30.94 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  31.94 
 
 		 555 aa  292  1e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>