More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2396 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2396  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 637 aa  1295    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  34.69 
 
 		 622 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  36.35 
 
 		 605 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  33.89 
 
 		 613 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  33.54 
 
 		 613 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1323  protein-export membrane protein SecD  34.15 
 
 		 611 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.970602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  33.59 
 
 		 613 aa  296  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  34.49 
 
 		 594 aa  287  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  32.83 
 
 		 595 aa  270  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  34.16 
 
 		 638 aa  267  4e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  34.07 
 
 		 624 aa  264  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  32.67 
 
 		 619 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  48.41 
 
 		 533 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  45.67 
 
 		 533 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.67 
 
 		 530 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.29 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  45.67 
 
 		 532 aa  249  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.21 
 
 		 1029 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  46.64 
 
 		 525 aa  249  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  46.64 
 
 		 532 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  44.74 
 
 		 531 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  46.43 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.58 
 
 		 530 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  45.71 
 
 		 533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.2 
 
 		 995 aa  243  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  45.71 
 
 		 532 aa  242  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  44.07 
 
 		 594 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  44.07 
 
 		 594 aa  241  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  44.76 
 
 		 534 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  44.24 
 
 		 530 aa  239  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08751  putative protein-export transmembrane SecDF protein  30.54 
 
 		 1001 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  45.36 
 
 		 533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  44.77 
 
 		 533 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  44.88 
 
 		 533 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  47.75 
 
 		 524 aa  233  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  46.29 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  42.81 
 
 		 607 aa  231  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  43.46 
 
 		 533 aa  232  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  43.65 
 
 		 533 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  41.5 
 
 		 413 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  43.68 
 
 		 532 aa  230  5e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  46.43 
 
 		 533 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  43.68 
 
 		 532 aa  230  6e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  30.25 
 
 		 981 aa  229  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  44.14 
 
 		 533 aa  227  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  43.68 
 
 		 534 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.9 
 
 		 853 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  42.27 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.58 
 
 		 534 aa  224  6e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  43.26 
 
 		 535 aa  223  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.55 
 
 		 856 aa  223  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  44.8 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.8 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  44.8 
 
 		 554 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  45.72 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  44.33 
 
 		 537 aa  221  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  43.25 
 
 		 531 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.8 
 
 		 995 aa  221  5e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  42.96 
 
 		 556 aa  220  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  39.58 
 
 		 529 aa  219  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  44.25 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  43.92 
 
 		 554 aa  216  9e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  42.91 
 
 		 532 aa  216  9e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  41.73 
 
 		 532 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  38.51 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  39.33 
 
 		 510 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.51 
 
 		 849 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  40.91 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  34.29 
 
 		 457 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  40.27 
 
 		 632 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  42.27 
 
 		 843 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  46.47 
 
 		 526 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.88 
 
 		 1055 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  39.93 
 
 		 632 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.43 
 
 		 990 aa  211  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.69 
 
 		 848 aa  211  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.44 
 
 		 991 aa  210  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  38.02 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  41.07 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.01 
 
 		 856 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  39.59 
 
 		 632 aa  208  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  41.45 
 
 		 503 aa  209  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  42.27 
 
 		 554 aa  209  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  42.24 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0681  preprotein translocase subunit SecD  37.12 
 
 		 587 aa  208  3e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  32.02 
 
 		 486 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.93 
 
 		 625 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.14 
 
 		 535 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.71 
 
 		 839 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  39.15 
 
 		 473 aa  206  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07161  preprotein translocase subunit SecD  31.54 
 
 		 489 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.145798 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0536  protein-export membrane protein SecD  38.99 
 
 		 441 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000245038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  37.07 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  40.07 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  32.28 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  38 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  40.52 
 
 		 419 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  40.22 
 
 		 406 aa  204  5e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  41.3 
 
 		 640 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>