More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2334 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  100 
 
 
455 aa  929    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  64.11 
 
 
430 aa  526  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  59.51 
 
 
431 aa  496  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  60.79 
 
 
423 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  58.31 
 
 
426 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  56.54 
 
 
440 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  53.35 
 
 
426 aa  432  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  45.43 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  44.58 
 
 
444 aa  328  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  44.31 
 
 
437 aa  328  9e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  44.15 
 
 
407 aa  317  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  43.2 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  42.54 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  45.45 
 
 
432 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  42.96 
 
 
433 aa  297  3e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  43.84 
 
 
445 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  42.82 
 
 
459 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  40.93 
 
 
426 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  40.79 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  37.41 
 
 
430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  40.54 
 
 
444 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  35.68 
 
 
431 aa  243  7e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  36.88 
 
 
441 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  39.62 
 
 
419 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  39.45 
 
 
421 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  39.07 
 
 
428 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  36.04 
 
 
407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.1 
 
 
422 aa  233  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  40.64 
 
 
408 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  40.64 
 
 
408 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  40.64 
 
 
408 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  38.23 
 
 
405 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  37.72 
 
 
426 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  37.98 
 
 
412 aa  230  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  40.11 
 
 
411 aa  230  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  41.33 
 
 
402 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  36.11 
 
 
407 aa  227  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  37.97 
 
 
424 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  38.74 
 
 
426 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  38.02 
 
 
402 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  37.65 
 
 
414 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  38.46 
 
 
423 aa  219  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  37.22 
 
 
417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  37.22 
 
 
417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  37.22 
 
 
417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  36.1 
 
 
429 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  37.6 
 
 
428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  39.15 
 
 
403 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  39.31 
 
 
404 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  33.89 
 
 
421 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  34.91 
 
 
470 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  36.59 
 
 
421 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  35.87 
 
 
423 aa  203  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  33.42 
 
 
413 aa  203  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  36.34 
 
 
432 aa  202  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  35.04 
 
 
401 aa  200  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  36.81 
 
 
391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  35.46 
 
 
444 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  32.74 
 
 
407 aa  186  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.87 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  36.93 
 
 
480 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  32.3 
 
 
443 aa  179  8e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  34.48 
 
 
409 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  33.49 
 
 
431 aa  179  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  32.37 
 
 
416 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  32.38 
 
 
390 aa  176  7e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  31.68 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  32.43 
 
 
415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  35.28 
 
 
410 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  32.35 
 
 
396 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  33.17 
 
 
409 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  33.17 
 
 
409 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  33.17 
 
 
409 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  33.57 
 
 
425 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  31.95 
 
 
406 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  31.3 
 
 
408 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  34.31 
 
 
413 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  33.84 
 
 
413 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  34.04 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  30.77 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  29.43 
 
 
412 aa  163  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  30.62 
 
 
412 aa  162  8.000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  31.4 
 
 
448 aa  162  9e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  31.58 
 
 
411 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  29.23 
 
 
420 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5618  amidohydrolase  34.14 
 
 
422 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.313113  normal  0.102085 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  30.9 
 
 
478 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  33.33 
 
 
420 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  30.31 
 
 
419 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  30.75 
 
 
440 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  32.65 
 
 
486 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  29.9 
 
 
411 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.83 
 
 
419 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  32.43 
 
 
413 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  30.07 
 
 
438 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  30.62 
 
 
411 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  33.08 
 
 
414 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  31.71 
 
 
482 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  32.37 
 
 
412 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>