89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2329 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 404 aa  791    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  34.91 
 
 		 2296 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1051 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  34.69 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.94 
 
 		 963 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  34.78 
 
 		 646 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  35.33 
 
 		 1130 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.02 
 
 		 1292 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 		 1750 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  32.76 
 
 		 1026 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31.09 
 
 		 1351 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 850 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.47 
 
 		 1030 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  41.18 
 
 		 652 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.3 
 
 		 693 aa  86.7  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 892 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 		 676 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  32.87 
 
 		 772 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  32.78 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  30.93 
 
 		 807 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  28.94 
 
 		 668 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  34.33 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  28 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.42 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 		 770 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  28.46 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  30.04 
 
 		 831 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 2831 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  28.69 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.33 
 
 		 930 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  36.77 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 579 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  27.24 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.52 
 
 		 1293 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1030 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  31.06 
 
 		 719 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  38.55 
 
 		 503 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  35.29 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.08 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  24.21 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 863 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.56 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.37 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.78 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1834 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  29.24 
 
 		 2350 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  31.97 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1763 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2917  NHL repeat containing protein  28.62 
 
 		 623 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.304592  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.76 
 
 		 627 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  41.9 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  27.64 
 
 		 1079 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  30.54 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  36.81 
 
 		 487 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.41 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 930 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13808  predicted protein  33.15 
 
 		 1675 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0947447  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 756 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  29.71 
 
 		 841 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  31.17 
 
 		 344 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  31.91 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  41.98 
 
 		 359 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  29.05 
 
 		 752 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  41.11 
 
 		 2961 aa  49.7  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.53 
 
 		 786 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.9 
 
 		 588 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  27.23 
 
 		 365 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19090  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  42.47 
 
 		 699 aa  47  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.718374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0097  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.09 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.328632  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2446  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.28 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0385674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  25.16 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  31.73 
 
 		 664 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1949 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  28.75 
 
 		 700 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  26.61 
 
 		 747 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  25 
 
 		 639 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1146 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  29.17 
 
 		 805 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  37.5 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4253  putative NHL repeat protein  31.17 
 
 		 584 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3573  hypothetical protein  36.05 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0820856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25270  NHL repeat protein  27.37 
 
 		 697 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.671028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  22.3 
 
 		 621 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  33.7 
 
 		 1046 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  23.66 
 
 		 359 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>