More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2283 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  100 
 
 		 427 aa  841    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  42 
 
 		 479 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  40.61 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  39.15 
 
 		 445 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1319  amine oxidase  37.74 
 
 		 470 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4715  amine oxidase  38.75 
 
 		 466 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0990147 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  34.25 
 
 		 436 aa  234  3e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  34.41 
 
 		 445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  32.04 
 
 		 495 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1349  amine oxidase  37.26 
 
 		 468 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  34.64 
 
 		 481 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  32.04 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  37.05 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  31.6 
 
 		 628 aa  189  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_51708  flavin-containing amine oxidase  31.55 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.771293  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  31.26 
 
 		 1199 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  32.81 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  36.38 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0744  amine oxidase  33.01 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0115844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0585  amine oxidase  34.29 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  29.29 
 
 		 536 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0575  amine oxidase  34.05 
 
 		 442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0549  amine oxidase  34.35 
 
 		 450 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.281302  normal  0.915784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2453  amine oxidase  29.93 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.950724  normal  0.0836974 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  29.45 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2535  amine oxidase  32.96 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2925  amine oxidase  33.49 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1664  amine oxidase  30.62 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155004  normal  0.105212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0613  amine oxidase  32.71 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.490888  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03580  lysine-specific histone demethylase Aof2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13000)  30.77 
 
 		 1274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5306  amine oxidase  28.16 
 
 		 409 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2690  amine oxidase  31.72 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0389849  normal  0.435459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0785  amine oxidase  33 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0940413  normal  0.297014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3726  amine oxidase  33.43 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0489  amine oxidase  28.64 
 
 		 456 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0104  amine oxidase  29.23 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0161  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.42 
 
 		 456 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0261  hypothetical protein  29.61 
 
 		 415 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.794532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0698  amine oxidase  28.75 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.613915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0413  amine oxidase  28.09 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3293  amine oxidase  29.29 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0007527  hitchhiker  0.000210093 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5659  amine oxidase  29.22 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44106  predicted protein  29.06 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.287897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4155  hypothetical protein  32.08 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  26.09 
 
 		 657 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6595  amine oxidase  29.56 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000326859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2620  amine oxidase  32.38 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.794942  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3036  amine oxidase  32.41 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0063  amine oxidase  28.14 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.203976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2233  amine oxidase  30.86 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0743875 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.07 
 
 		 492 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0035  amine oxidase  29.43 
 
 		 485 aa  99.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1419  amine oxidase  30.38 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0377  amine oxidase  31.62 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3178  amine oxidase  30.75 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1963  amine oxidase  30.81 
 
 		 446 aa  98.6  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4367  amine oxidase  29.88 
 
 		 463 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4843  amine oxidase  29.74 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1769  amine oxidase  28.81 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.998946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  29.58 
 
 		 449 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_15959  amine oxidase  29.37 
 
 		 999 aa  97.1  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4579  amine oxidase  30.77 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130535  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0038  amine oxidase  28.99 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  24.49 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3468  amine oxidase  30.5 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  28.08 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  28.27 
 
 		 459 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  30.63 
 
 		 445 aa  92.8  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0209  amine oxidoreductase domain-containing protein  28.4 
 
 		 469 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  28.54 
 
 		 490 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0203  amine oxidase  26.63 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5276  amine oxidase  28.02 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0443  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 		 476 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0204  amine oxidase  27.21 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  28.19 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  28.19 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0048  twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 		 476 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.708369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  27.65 
 
 		 469 aa  86.3  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25.48 
 
 		 482 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3508  amine oxidase  28.83 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.95 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1384  amine oxidase  27.92 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.120494 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.17 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.41 
 
 		 454 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.81 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  23.53 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  23.53 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1593  amine oxidase  30.65 
 
 		 423 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.97 
 
 		 478 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  28.54 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.75 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  27.77 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.13 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0312  amine oxidase  27.12 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.54 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30946  predicted protein  24.73 
 
 		 484 aa  77.8  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00734662  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  27.75 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.54 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.54 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>