26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2254 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  705    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  45.88 
 
 
348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  45.03 
 
 
345 aa  304  1.0000000000000001e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  43.84 
 
 
353 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  45.03 
 
 
340 aa  282  6.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  33.33 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  31.97 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  33.85 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  33.09 
 
 
287 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  32.09 
 
 
298 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  26.94 
 
 
300 aa  119  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  32.2 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  30.72 
 
 
324 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  29.73 
 
 
264 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  32.01 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  30.88 
 
 
288 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  21.64 
 
 
298 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  31.06 
 
 
213 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  31.06 
 
 
213 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.06 
 
 
213 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  31.06 
 
 
213 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.3 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.3 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  30.3 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.55 
 
 
213 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  29.55 
 
 
213 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.443134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>