57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2253 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 		 572 aa  1117    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  34.23 
 
 		 591 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2393  polymorphic outer membrane protein  31.41 
 
 		 659 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  34.09 
 
 		 526 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  28.36 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  33.6 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  29.63 
 
 		 575 aa  133  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3086  polymorphic outer membrane protein  30.15 
 
 		 665 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  28.88 
 
 		 516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1078  putative lipoprotein  31.68 
 
 		 302 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.839732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 		 575 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  29.3 
 
 		 541 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  28.33 
 
 		 655 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1575  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 384 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.56 
 
 		 530 aa  87.8  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3514  polymorphic membrane protein  28.62 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00452476  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1023 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  30.39 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  27.37 
 
 		 2192 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  26.24 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  26.01 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  28.94 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.51 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0244  hypothetical protein  32.46 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.601423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  30.86 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1061 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  26.3 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  23.81 
 
 		 601 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  27.8 
 
 		 462 aa  54.3  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  26.71 
 
 		 913 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  25.71 
 
 		 2160 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  25.53 
 
 		 468 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  25.2 
 
 		 852 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  26.04 
 
 		 465 aa  50.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  35.09 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  26.46 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03795  putative secreted protein  49.09 
 
 		 59 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  25.32 
 
 		 1318 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  25.33 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  28.49 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1246  putative lipoprotein  27.84 
 
 		 842 aa  47.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  30.06 
 
 		 459 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  25.61 
 
 		 505 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  25 
 
 		 2031 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  25.15 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  30.06 
 
 		 1332 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  29.82 
 
 		 2042 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  28.31 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  25.2 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  26.64 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  30.94 
 
 		 415 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  26.4 
 
 		 481 aa  44.3  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  24.87 
 
 		 454 aa  44.3  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  30.21 
 
 		 433 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  28.7 
 
 		 1037 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  31.33 
 
 		 717 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  26.77 
 
 		 1197 aa  43.5  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>