More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2238 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  100 
 
 
104 aa  209  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 
103 aa  125  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  1.74433e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 
103 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
104 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.88 
 
 
223 aa  121  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 
104 aa  119  1e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  1.52954e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  119  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
103 aa  118  2e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
104 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  116  1e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  56.44 
 
 
102 aa  116  1e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  5.98947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  50 
 
 
105 aa  116  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  52.43 
 
 
103 aa  115  2e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  5.79103e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  115  2e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  54.37 
 
 
104 aa  115  2e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.35569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  49.51 
 
 
103 aa  114  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.62091e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  53.06 
 
 
105 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  3.14721e-11  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
104 aa  113  9e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  54.46 
 
 
103 aa  113  9e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
105 aa  113  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
114 aa  112  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  53.47 
 
 
103 aa  112  2e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.21247e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
106 aa  112  2e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 
105 aa  112  2e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  112  2e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.49 
 
 
103 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  51.46 
 
 
103 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
132 aa  111  4e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.0004e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
146 aa  110  7e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 
104 aa  110  7e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 
125 aa  110  8e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  109  1e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  109  1e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  2.70537e-12  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  109  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  6.20592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  109  1e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  53.4 
 
 
102 aa  109  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.83343e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 
103 aa  108  2e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  109  2e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
102 aa  108  2e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0086  50S ribosomal protein L21  59.22 
 
 
104 aa  108  4e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.09341e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  50 
 
 
104 aa  107  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.33447e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.57 
 
 
149 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  52.48 
 
 
102 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.44419e-06  hitchhiker  2.01625e-07 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
103 aa  107  7e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
102 aa  107  8e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.81262e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  2.36829e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.93081e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  52.48 
 
 
171 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.45664e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  2.82146e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
124 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  6.37379e-11  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  50.49 
 
 
103 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.57 
 
 
103 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.80256e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  4.50477e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.47108e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  6.34591e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  104  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 
102 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.40365e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  104  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  5.64167e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  104  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  54.08 
 
 
100 aa  104  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  105  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  104  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.30006e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.33925e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
102 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.16052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  104  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.28697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  104  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
103 aa  103  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 
102 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 
103 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
142 aa  103  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
102 aa  103  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.07252e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.68941e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 
101 aa  103  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  1.90707e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  3.3092e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  103  9e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.86548e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
115 aa  102  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.56676e-07  decreased coverage  3.56458e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 
103 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  7.89228e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
102 aa  102  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59032e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 
188 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
103 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  4.42245e-09  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 
103 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 
103 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>