More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2230 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2230  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
707 aa  1415    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129446  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 
1557 aa  234  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1419 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  34.75 
 
 
1629 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
463 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
601 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 
601 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 
933 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
1002 aa  184  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
687 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.83 
 
 
969 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
431 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
755 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
927 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 
1362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
977 aa  173  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  35.88 
 
 
1361 aa  173  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
431 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1274 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
1352 aa  171  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
882 aa  170  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
1271 aa  170  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1965 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.55 
 
 
663 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 
989 aa  169  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
989 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  37.94 
 
 
993 aa  168  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
733 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
969 aa  167  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  36.25 
 
 
745 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  38.28 
 
 
1003 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
975 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
896 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
1021 aa  165  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  36.05 
 
 
745 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.74 
 
 
1124 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
1131 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
721 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1287 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
917 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.01 
 
 
1431 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1195 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 
823 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  34.73 
 
 
725 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 
745 aa  161  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.39 
 
 
1046 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.08 
 
 
853 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
1385 aa  160  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1172 aa  160  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.51 
 
 
1058 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
858 aa  160  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
869 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2941  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
696 aa  159  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.843677  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
866 aa  159  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1131 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  31.18 
 
 
861 aa  158  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  33.16 
 
 
1407 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 
549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
1146 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
970 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.81 
 
 
1297 aa  157  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.75 
 
 
1346 aa  157  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0975  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1130 aa  157  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.537982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1173 aa  157  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
748 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  31.11 
 
 
1885 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
701 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 
1184 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  27.1 
 
 
1130 aa  156  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  30.99 
 
 
781 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1126 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.4 
 
 
1133 aa  154  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
1478 aa  154  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  31.81 
 
 
2051 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
746 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
1711 aa  154  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
791 aa  153  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
678 aa  154  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
631 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.74 
 
 
653 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
816 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 
844 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
939 aa  153  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
840 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6296  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
673 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312585  normal  0.564635 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
572 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.8 
 
 
798 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1826  histidine kinase  29.41 
 
 
828 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.881555  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  33.8 
 
 
676 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
1313 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  29.32 
 
 
1070 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.13 
 
 
763 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1361 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0191  response regulator receiver hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
519 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835451  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
1207 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 
1156 aa  151  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.97 
 
 
1361 aa  151  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
1048 aa  151  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>