More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2220 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
928 aa  1838    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.11 
 
 
1202 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.41 
 
 
816 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.7 
 
 
833 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  36.5 
 
 
1135 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1369 aa  376  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.35 
 
 
1064 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.87 
 
 
852 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.27 
 
 
2213 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
929 aa  365  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.67 
 
 
921 aa  365  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.77 
 
 
1763 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  39.66 
 
 
1014 aa  356  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 
1165 aa  355  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
1363 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.84 
 
 
1340 aa  354  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 
1118 aa  354  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
916 aa  353  8.999999999999999e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  39.82 
 
 
1346 aa  353  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.66 
 
 
1310 aa  352  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
1266 aa  349  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
1611 aa  348  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  41.71 
 
 
977 aa  349  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
1069 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1788 aa  349  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.7 
 
 
1090 aa  347  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
977 aa  347  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
1267 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.14 
 
 
923 aa  343  7e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1582 aa  343  8e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.67 
 
 
752 aa  343  8e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
946 aa  342  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.76 
 
 
1433 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  35.1 
 
 
850 aa  340  5e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.6 
 
 
1284 aa  340  9e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  31.7 
 
 
2035 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  41.7 
 
 
758 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.24 
 
 
1313 aa  340  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1326 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1331 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
1398 aa  338  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 
1245 aa  337  7e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 
927 aa  336  9e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.13 
 
 
1040 aa  336  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  40.34 
 
 
847 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.28 
 
 
1574 aa  335  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 
1622 aa  335  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  35.49 
 
 
1322 aa  335  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  37.11 
 
 
1417 aa  335  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
893 aa  335  3e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.47 
 
 
1033 aa  334  4e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1384 aa  334  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.86 
 
 
1499 aa  333  7.000000000000001e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1765 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
1245 aa  333  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  34.1 
 
 
1653 aa  332  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
2654 aa  332  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.27 
 
 
1397 aa  332  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1768 aa  330  6e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  37.59 
 
 
1418 aa  330  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.36 
 
 
1193 aa  330  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.28 
 
 
1179 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
1260 aa  328  3e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1426 aa  327  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1771 aa  327  7e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.44 
 
 
745 aa  327  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.18 
 
 
1765 aa  326  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.07 
 
 
757 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 
990 aa  326  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
985 aa  325  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
993 aa  324  6e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  35.25 
 
 
1626 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
818 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
812 aa  322  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
1245 aa  321  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1767 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  35.19 
 
 
1297 aa  320  7e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  41.05 
 
 
1177 aa  320  7e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.71 
 
 
636 aa  320  7e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1767 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1258 aa  320  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
1230 aa  319  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.38 
 
 
1233 aa  320  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.42 
 
 
830 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  36.35 
 
 
1030 aa  318  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 
991 aa  319  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
835 aa  318  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
1767 aa  318  4e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  30.57 
 
 
1255 aa  316  9.999999999999999e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  30.98 
 
 
1683 aa  316  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
920 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
1548 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1820 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  34.61 
 
 
1200 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  39.39 
 
 
833 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  37.61 
 
 
1351 aa  315  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  36.3 
 
 
1287 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1131 aa  314  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 
1234 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 
818 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>