173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2194 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2194  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
123 aa  249  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343507  normal  0.0385809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  34.48 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  33.63 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  33.62 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  30.97 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2889  dihydroneopterin aldolase  35 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  30.09 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  35.09 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03450  dihydroneopterin aldolase FolB, putative  35.79 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  35.4 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2191  dihydroneopterin aldolase  32.41 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  37.25 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1044  dihydroneopterin aldolase  35.64 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00112146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000108398 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  30.7 
 
 
120 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  31.03 
 
 
121 aa  64.3  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 
120 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  30.48 
 
 
120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  36.19 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  34.21 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1675  dihydroneopterin aldolase  33.96 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0522559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  30.17 
 
 
292 aa  62  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  29.52 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000922875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  32.76 
 
 
121 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  29.52 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  31.58 
 
 
120 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  31.43 
 
 
128 aa  60.1  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  32.38 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1182  dihydroneopterin aldolase  38.64 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.275073 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  32.17 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  28.07 
 
 
122 aa  59.3  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1032  dihydroneopterin aldolase  32.14 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1208  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0687  dihydroneopterin aldolase  33.98 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0757242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1072  dihydroneopterin aldolase  29.2 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  36.46 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0601  dihydroneopterin aldolase  33.01 
 
 
134 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.390191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  30.43 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2345  dihydroneopterin aldolase  29.9 
 
 
118 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  33.64 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  28.04 
 
 
276 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0928  dihydroneopterin aldolase family protein  30.77 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1280  dihydroneopterin aldolase  24.07 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000396962  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  28.95 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1464  dihydroneopterin aldolase  37.89 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  35.34 
 
 
470 aa  55.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0506  dihydroneopterin aldolase  34.69 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.250625  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2091  dihydroneopterin aldolase  37.5 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.951918 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  35.58 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1812  dihydroneopterin aldolase  26.72 
 
 
120 aa  54.7  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109072  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  38.46 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0495  dihydroneopterin aldolase  34.74 
 
 
123 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0418913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0326  dihydroneopterin aldolase  28.87 
 
 
118 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1331  dihydroneopterin aldolase  29.81 
 
 
124 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.951458  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
130 aa  53.9  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2182  dihydroneopterin aldolase  34.02 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.441535  normal  0.0141714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2140  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0193  dihydroneopterin aldolase  34.02 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.600595  normal  0.861328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1428  dihydroneopterin aldolase  30.1 
 
 
120 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1970  dihydroneopterin aldolase  36.08 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.380484 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2006  hypothetical protein  28.43 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1956  dihydroneopterin aldolase  32.71 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2349  dihydroneopterin aldolase  29.82 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0828441  normal  0.0512574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5834  dihydroneopterin aldolase  33 
 
 
116 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.384012  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2988  dihydroneopterin aldolase  28.87 
 
 
121 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2011  hypothetical protein  28.43 
 
 
112 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0269  dihydroneopterin aldolase family protein  31.43 
 
 
125 aa  51.6  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0814  dihydroneopterin aldolase  34.74 
 
 
130 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  31.25 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  29.52 
 
 
125 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4226  dihydroneopterin aldolase  33.68 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.265361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1246  dihydroneopterin aldolase  32 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0419783  normal  0.0387955 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2676  D-erythro-7,8-dihydroneopterin triphosphate epimerase  29.63 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.581107  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  32.74 
 
 
124 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1249  dihydroneopterin aldolase  33.68 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
119 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  35.24 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
131 aa  50.4  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  28.97 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0098  dihydroneopterin aldolase; RBL03201  35.24 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.473342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0172  dihydroneopterin aldolase  26.55 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  29.21 
 
 
127 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  33.33 
 
 
841 aa  49.7  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0457  dihydroneopterin aldolase  32.46 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.660964  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0761  dihydroneopterin aldolase  35.85 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.811624  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  30.36 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0517  dihydroneopterin aldolase  32.99 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>