23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2126 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2126  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 
619 aa  1260    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.520971 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1727  peptidase M14, carboxypeptidase A  52.71 
 
 
573 aa  587  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1934  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.48 
 
 
563 aa  319  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0111552  hitchhiker  0.00000196465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  36.26 
 
 
557 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4108  peptidase M14, carboxypeptidase A  35.65 
 
 
557 aa  290  5.0000000000000004e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2921  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.93 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1581  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.65 
 
 
559 aa  283  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3595  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.89 
 
 
553 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0167852 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3057  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.89 
 
 
568 aa  266  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3064  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.72 
 
 
558 aa  263  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.211904  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0781  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.78 
 
 
563 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  39.74 
 
 
815 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  43.48 
 
 
423 aa  47.4  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.08 
 
 
889 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  24.14 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  41.07 
 
 
262 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  22.07 
 
 
1034 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0145  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.66 
 
 
683 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.06 
 
 
378 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0196  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.37 
 
 
386 aa  44.7  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4213  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.92 
 
 
684 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0146  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.66 
 
 
683 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.358268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0142  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.66 
 
 
683 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>