274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2067 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2067  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
318 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3155  ATPase  40.78 
 
 
284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1094  ATPase, AAA family protein  39.58 
 
 
284 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.839065  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1788  ATPase  39.43 
 
 
281 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29130  ATPase  39.07 
 
 
281 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107931 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2058  ATPase  38.1 
 
 
277 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3905  ATPase, AAA family  38.71 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.595065  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1580  AAA ATPase, central region:AAA ATPase, central region  38.57 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.261649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3984  hypothetical protein  38.71 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2767  ATPase  37.25 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.313404  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1409  ATPase  38.71 
 
 
281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0108  ATPase  40.22 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0213616  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2357  ATPase  37.81 
 
 
284 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.797893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3952  ATPase central domain-containing protein  38.3 
 
 
284 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5020  AAA ATPase central domain protein  39.21 
 
 
278 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.422648  normal  0.019419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1385  AAA ATPase central domain protein  39.64 
 
 
283 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2134  ATPase  39.13 
 
 
291 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00244059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3873  ATPase  37.63 
 
 
281 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0352016  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0548  ATPase  38.75 
 
 
279 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2516  ATPase  39.36 
 
 
278 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.352302  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0864  AAA ATPase central domain protein  39 
 
 
297 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125814  normal  0.499704 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4094  ATPase  37.63 
 
 
281 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.271648  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0986  ATPase  38.55 
 
 
292 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4573  AAA family ATPase  37.63 
 
 
281 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0238067  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0517  AAA ATPase, central region:ATPase  40.07 
 
 
301 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1311  ATPase  38.49 
 
 
279 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2653  AAA family ATPase  38.49 
 
 
279 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1316  ATPase  37.63 
 
 
281 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436142  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3556  ATPase central domain-containing protein  37.72 
 
 
280 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.187416  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1408  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.57 
 
 
282 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2879  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.37 
 
 
280 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1883  putative clpA/clpB family protein  37.77 
 
 
280 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406023  normal  0.307774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1191  ATPase  38.13 
 
 
279 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32860  ATPase, AAA family protein  38.85 
 
 
281 aa  165  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4467  AAA ATPase central domain protein  36.88 
 
 
284 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.179152  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3298  hypothetical protein  37.68 
 
 
281 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1023  AAA ATPase, central region:ATPase  39.11 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.58673  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1605  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.863754  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4631  ATPase central domain-containing protein  38.08 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0758451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5094  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.08 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229004  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2872  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.1 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0698667 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0929  AAA ATPase central domain protein  38.91 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240465  normal  0.607082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1945  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.11 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42736  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0809  ATPase  36.24 
 
 
284 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652104  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1940  ATPase central domain-containing protein  37.72 
 
 
283 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422429 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0998  hypothetical protein  38.13 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.451965  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0899  ATPase  37.67 
 
 
360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02167  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  37.63 
 
 
278 aa  163  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1661  ATPase  36.52 
 
 
284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1719  ATPase central domain-containing protein  36.24 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631647  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3608  AAA ATPase central domain protein  38.63 
 
 
289 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.496684  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0860  ATPase  36.52 
 
 
280 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4638  ATPase  38.79 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.10339 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0906  ATPase  36.68 
 
 
289 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.166593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0894  ATPase  35.97 
 
 
279 aa  162  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5168  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.72 
 
 
283 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0802  AAA family ATPase  36.4 
 
 
284 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.736454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4254  ATPase protein  35.36 
 
 
288 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7091  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.87 
 
 
281 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2251  ATPase  38.79 
 
 
280 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2371  ATPase  40.51 
 
 
280 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6213  ATPase  38.87 
 
 
281 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.010432  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0945  ATPase  40.51 
 
 
280 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.799967  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1170  AAA family ATPase  40.51 
 
 
280 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0299  ATPase, AAA family protein  40.93 
 
 
280 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1016  ATPase, AAA family protein  40.93 
 
 
280 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2682  AAA_5 ATPase  35.25 
 
 
285 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0320361  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1589  AAA_5 ATPase  36.88 
 
 
284 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1178  AAA family ATPase  40.51 
 
 
280 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1331  ATPase, AAA family protein  40.93 
 
 
317 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00666024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2236  ATPase central domain-containing protein  35.13 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1936  ATPase, AAA family protein  40.93 
 
 
317 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0849  ATPase, AAA family protein  40.93 
 
 
317 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.1444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0047  ATPase central domain-containing protein  34.06 
 
 
281 aa  155  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5674  AAA ATPase  39.15 
 
 
280 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0965  ATPase, AAA family protein  40.08 
 
 
335 aa  155  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1222  ATPase  37.23 
 
 
286 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1720  ATPase  39.18 
 
 
286 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.501312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2355  ATPase central domain-containing protein  39.18 
 
 
286 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2332  ATPase  39.18 
 
 
286 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3315  putative ATPase, AAA family protein  39.24 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492501  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1430  ATPase  38.08 
 
 
345 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1231  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.24 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.62341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2894  ATPase  37.45 
 
 
289 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220244  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0437  MoxR-like ATPases  35.21 
 
 
280 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.405282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1639  ATPase  37.75 
 
 
281 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.435495  normal  0.821163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2060  ATPase-like protein  38.54 
 
 
330 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.598093  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2101  ATPase  38.4 
 
 
280 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.316568 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2541  ATPase  39.5 
 
 
281 aa  150  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104036  normal  0.552897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2090  ATPase AAA_5  38.24 
 
 
281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0794647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2505  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.26 
 
 
315 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.543373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4138  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.5 
 
 
280 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18588  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2122  ATPase  36.56 
 
 
280 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787616  normal  0.0289153 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1977  ATPase  37.97 
 
 
294 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6260  ATPase  36.55 
 
 
280 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3462  ATPase  36.67 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0889695  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1910  ATPase  36.67 
 
 
280 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.102293  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2638  ATPase  37.76 
 
 
281 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.858309  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3717  ATPase-like protein  33.33 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2074  ATPase  33.57 
 
 
324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.678212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>