More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2018 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  100 
 
 		 425 aa  847    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  54.31 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  51.15 
 
 		 403 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  49.87 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  49.61 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  48.74 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  49.61 
 
 		 399 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  49.61 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  49.61 
 
 		 399 aa  363  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  49.1 
 
 		 399 aa  363  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  48.33 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  48.59 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  48.84 
 
 		 399 aa  359  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  49.35 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  49.62 
 
 		 393 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  49.75 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  43.7 
 
 		 406 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  52.48 
 
 		 394 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  43.41 
 
 		 398 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  47.22 
 
 		 401 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  42.75 
 
 		 398 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  40.9 
 
 		 395 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0013  isochorismate synthase  44.53 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0016  isochorismate synthase  44.28 
 
 		 391 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  41.9 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  42.15 
 
 		 395 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  40.55 
 
 		 402 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1490  isochorismate synthase  41.25 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0238943  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1026  isochorismate synthase  53.31 
 
 		 484 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102724 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1621  isochorismate synthase  42.38 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  49.69 
 
 		 377 aa  278  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33230  isochorismate synthase family protein  45.13 
 
 		 383 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.523116 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  40.83 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2276  isochorismate synthase  43.52 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  39.22 
 
 		 391 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  38.86 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  39.22 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  38.86 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  38.86 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  38.86 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2727  isochorismate synthase  55.36 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  39.22 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  38.86 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  39.22 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  38.5 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  39.22 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  38.6 
 
 		 391 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  38.24 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  38.24 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2382  isochorismate synthases  44.41 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.145402  normal  0.843674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1387  isochorismate synthases  44.28 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.483804  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1405  isochorismate synthases  44.28 
 
 		 365 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4680  isochorismate synthase  44.01 
 
 		 365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.182691  normal  0.147451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4032  isochorismate synthase  39.95 
 
 		 376 aa  233  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1421  isochorismate synthases  43.98 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.400278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13241  isochorismate synthase entC  41.94 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.732317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3683  isochorismate synthase  43.98 
 
 		 368 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.790818  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1787  isochorismate synthases  39.01 
 
 		 365 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  45.13 
 
 		 482 aa  202  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  43.02 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  39.58 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.64 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  42.11 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  39.34 
 
 		 415 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  42.01 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  42.48 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  42.55 
 
 		 486 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  35.16 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  40.38 
 
 		 467 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  38.41 
 
 		 461 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2720  isochorismate synthase  39.15 
 
 		 441 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.307499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  41.11 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  38.99 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  40.96 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0516  isochorismate synthases  40.07 
 
 		 428 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.868248  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  42.91 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  33.33 
 
 		 460 aa  169  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0536  isochorismate synthase  40.52 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 		 464 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  38.21 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.07 
 
 		 464 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  36.36 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.82 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  38.66 
 
 		 554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 		 464 aa  166  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  42.21 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.57 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  38.6 
 
 		 506 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  36.5 
 
 		 492 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  41.57 
 
 		 484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  36.5 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 		 464 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  37.42 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0466  isochorismate synthase  40.59 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2828  isochorismate synthase  36.27 
 
 		 487 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.120626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  38.27 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>