13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1870 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  100 
 
 		 949 aa  1964    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  22.97 
 
 		 620 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  23.01 
 
 		 790 aa  99.4  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1344 aa  78.2  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  23.46 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  30.65 
 
 		 1532 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  23.13 
 
 		 620 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  21.59 
 
 		 620 aa  72  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  22.46 
 
 		 618 aa  72  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  22.84 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  22.86 
 
 		 657 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  28.21 
 
 		 1432 aa  69.3  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  22.14 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>