More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1846 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1846  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
212 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.349565  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
215 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  43.13 
 
 
210 aa  174  1e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 
210 aa  173  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 
236 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1194  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 
217 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 
210 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
210 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  40.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  41.9 
 
 
214 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
239 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
210 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
210 aa  166  3e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
219 aa  166  3e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 
210 aa  166  3e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
210 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
210 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 
212 aa  165  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  38.57 
 
 
214 aa  164  1e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
210 aa  163  1e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
210 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1230  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.05 
 
 
215 aa  162  4e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 
210 aa  162  5e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 
216 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 
218 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.45 
 
 
218 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 
216 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
215 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
209 aa  160  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
218 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1997  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
210 aa  158  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
209 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
212 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
216 aa  158  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
209 aa  158  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  39.61 
 
 
216 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.1 
 
 
209 aa  158  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  39.13 
 
 
214 aa  158  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
210 aa  158  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  38.1 
 
 
214 aa  158  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  37.98 
 
 
218 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.91 
 
 
213 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
210 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0677  two component LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
211 aa  157  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00533706  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0703  LuxR family transcriptional regulator  37.91 
 
 
211 aa  157  8e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000151408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  42.18 
 
 
209 aa  157  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  36.67 
 
 
214 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 
219 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
210 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1810  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 
218 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
214 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.21601e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  7.50596e-08 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.24814e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.57663e-07  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.0455e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.44757e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  38.46 
 
 
218 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  5.84326e-05  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1400  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
216 aa  155  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.973321  normal  0.0605156 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
208 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  155  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2182e-06  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  6.60452e-09  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  38.65 
 
 
214 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.88339e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1191  two component LuxR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
219 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.26498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 
216 aa  155  5e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
219 aa  154  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
215 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
215 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  38.16 
 
 
214 aa  154  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  7.46753e-07  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
215 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2415  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
217 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  37.68 
 
 
214 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  37.98 
 
 
218 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2463  response regulator receiver  39.45 
 
 
217 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.14 
 
 
216 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.48978e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1317  response regulator  37.09 
 
 
220 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.500574  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  37.68 
 
 
226 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2501  response regulator  37.02 
 
 
218 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000242353  normal  0.495647 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1429  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
211 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.85494 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  38.1 
 
 
220 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  35.71 
 
 
227 aa  153  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.89156e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  37.02 
 
 
218 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  38.65 
 
 
215 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 
216 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 
211 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 
215 aa  152  3e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  35.55 
 
 
214 aa  152  3e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  152  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  39.05 
 
 
215 aa  152  3e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  152  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  1.6111e-08 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  37.5 
 
 
218 aa  152  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  7.06228e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>