More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1840 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  49.47 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 213 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 192 aa  101  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 201 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 228 aa  91.7  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 193 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 243 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  29.78 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  51.92 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  26.35 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 420 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  32.14 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  35.44 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1751  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000821157  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 245 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 307 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.18 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  31.25 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>