221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1824 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
306 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  66 
 
 
276 aa  337  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  67.95 
 
 
273 aa  335  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  53.36 
 
 
296 aa  285  9e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  40.55 
 
 
671 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  40.55 
 
 
671 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  38.91 
 
 
671 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 
348 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  38.24 
 
 
349 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  38.31 
 
 
664 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  38.01 
 
 
349 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 
354 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
339 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 
288 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.29 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.98 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
876 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
211 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 
293 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  29.74 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  26.63 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.86 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.04 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.77 
 
 
624 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
336 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  27.38 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.22 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 
182 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.22 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
307 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 
219 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 
211 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
238 aa  63.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  23.03 
 
 
246 aa  63.2  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 
220 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.77 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  29.94 
 
 
204 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  31.69 
 
 
196 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  26.9 
 
 
613 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  27.19 
 
 
630 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.33 
 
 
652 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  26.9 
 
 
613 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  26.9 
 
 
613 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  22.81 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  25.85 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.93 
 
 
553 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  28.97 
 
 
617 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  31.76 
 
 
652 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  23.79 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.67 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.97 
 
 
629 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  29.79 
 
 
214 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  28.8 
 
 
617 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  24.38 
 
 
211 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 
236 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  30.28 
 
 
616 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 
214 aa  58.9  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  25.97 
 
 
207 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  25.82 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  22.79 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  25.82 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  25.97 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  25.97 
 
 
207 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  31.03 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  27.04 
 
 
211 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.28 
 
 
600 aa  57  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  21.51 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>