177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1822 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 467 aa  918    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  45.63 
 
 		 417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  46.07 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  46.51 
 
 		 419 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  42.57 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  42.44 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  38.31 
 
 		 414 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  38.22 
 
 		 412 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  38.46 
 
 		 414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  38.68 
 
 		 414 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  38.22 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  38 
 
 		 412 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  38 
 
 		 412 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  35.01 
 
 		 414 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  38.08 
 
 		 418 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  33.87 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  36.04 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  36.18 
 
 		 415 aa  233  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  35.82 
 
 		 415 aa  229  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  34.3 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  36.27 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  36.65 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  33.74 
 
 		 506 aa  190  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 410 aa  189  8e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  34.8 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  30.02 
 
 		 515 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  34.08 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  34.08 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  34.08 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  31.05 
 
 		 410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.98 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  30.23 
 
 		 423 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  35.78 
 
 		 517 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  29.11 
 
 		 442 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  32.81 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  37.27 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  32.02 
 
 		 410 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  30.8 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  33.24 
 
 		 409 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  28.51 
 
 		 483 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  36.83 
 
 		 537 aa  173  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.98 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.94 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.32 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  33.64 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  34.16 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  31.87 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  33.02 
 
 		 409 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  32.61 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  32.27 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  33.23 
 
 		 412 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  30.2 
 
 		 408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  35.18 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  31.63 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  32.6 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 		 400 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  33.33 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  31.17 
 
 		 400 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  31.79 
 
 		 400 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  31.79 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  34.67 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  29.26 
 
 		 408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  29.81 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  34.06 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  32.14 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  24.62 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  30.09 
 
 		 425 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.2 
 
 		 393 aa  123  8e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.62 
 
 		 407 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  29.59 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  30.29 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.05 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.92 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  29.41 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.67 
 
 		 387 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.13 
 
 		 407 aa  106  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  30.42 
 
 		 390 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  30.49 
 
 		 380 aa  104  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.4 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  28.97 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  28.96 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  30.67 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  29.48 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.75 
 
 		 400 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.75 
 
 		 400 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.44 
 
 		 400 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  24.57 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.15 
 
 		 381 aa  97.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  28.44 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.66 
 
 		 418 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.13 
 
 		 385 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.78 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.52 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>