20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1783 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  855    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  26.82 
 
 		 769 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  22.61 
 
 		 709 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  25.97 
 
 		 736 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  29.94 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  26.09 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  28.24 
 
 		 442 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  25.58 
 
 		 420 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  25 
 
 		 406 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  30.11 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  26.92 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  29.55 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  29.03 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  28.75 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  24.05 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  26.32 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  27.18 
 
 		 427 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  25.6 
 
 		 203 aa  43.9  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.11 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  26.32 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>