More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1762 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  100 
 
 		 412 aa  835    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  38.61 
 
 		 379 aa  262  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  38.03 
 
 		 379 aa  262  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  38.33 
 
 		 379 aa  256  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  38.72 
 
 		 380 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  37.73 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.56 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  37.11 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  35.93 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  36.76 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  39.72 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  38.17 
 
 		 385 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  37.1 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  41.6 
 
 		 389 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  36.1 
 
 		 380 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  39.44 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  37.6 
 
 		 385 aa  242  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  37.43 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  40.9 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  35.66 
 
 		 382 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.46 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  37.23 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  37.74 
 
 		 386 aa  235  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.4 
 
 		 387 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  37.02 
 
 		 384 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.96 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  36.95 
 
 		 363 aa  229  5e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.97 
 
 		 382 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  34.64 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  36.89 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.46 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  33.69 
 
 		 384 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  33.42 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 384 aa  225  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.43 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  33.88 
 
 		 382 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  37.21 
 
 		 382 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.17 
 
 		 387 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  35.54 
 
 		 362 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  35.54 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.89 
 
 		 362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.77 
 
 		 385 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  38.5 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  35.84 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  32.23 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  32.7 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  31.64 
 
 		 374 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  38.95 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  36.49 
 
 		 395 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  37.53 
 
 		 401 aa  209  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.86 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  34.6 
 
 		 396 aa  206  9e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  34.78 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  35.28 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  39.01 
 
 		 383 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  32.13 
 
 		 360 aa  203  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.03 
 
 		 383 aa  202  7e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  33.5 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  36.34 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.38 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  37.77 
 
 		 375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  32.88 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  33.06 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  34.15 
 
 		 415 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 383 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  33.77 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  32.97 
 
 		 391 aa  193  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  35.81 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  34.49 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  31.67 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  32.97 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  32.04 
 
 		 370 aa  189  9e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  36.01 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  31.88 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  32.61 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  34.46 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  32.8 
 
 		 396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  34.52 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  33.16 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.6 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  32.89 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  30.87 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  30.87 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  34.34 
 
 		 406 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  33.85 
 
 		 401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  33.94 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  35.82 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  34.63 
 
 		 397 aa  182  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  34.01 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  31.44 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  34.29 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  32.89 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  32.82 
 
 		 406 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0713  aminotransferase, class V  33.33 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  35.66 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>