158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1710 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  100 
 
 
560 aa  1134    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.02 
 
 
817 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.22 
 
 
817 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.61 
 
 
864 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.53 
 
 
831 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.07 
 
 
813 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0437  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.72 
 
 
158 aa  120  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  26.21 
 
 
356 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0871  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0691  hypothetical protein  33.12 
 
 
159 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484986  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  37.67 
 
 
820 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0743  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0691  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00544523  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0677  hypothetical protein  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4501  rhodanese domain family protein  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000066362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0943  NADH dehydrogenase  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000101023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0835  NADH dehydrogenase  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00145998  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0875  NADH dehydrogenase  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000403933 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  27.02 
 
 
354 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  27.02 
 
 
354 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  27.02 
 
 
354 aa  111  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  28.63 
 
 
938 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.95 
 
 
837 aa  110  8.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  26.07 
 
 
354 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  26.07 
 
 
354 aa  110  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2893  NADH dehydrogenase  31.87 
 
 
160 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0562  NADH dehydrogenase  29.88 
 
 
160 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000829032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1185  hypothetical protein  37.42 
 
 
192 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.491301  normal  0.832453 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.06 
 
 
834 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0814  hypothetical protein  37.42 
 
 
196 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1150  hypothetical protein  35.48 
 
 
191 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000124979  decreased coverage  0.000000301947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0647  hypothetical protein  31.41 
 
 
158 aa  89.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0976  putative NADH dehydrogenase  32.5 
 
 
163 aa  85.5  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.37557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1738  hypothetical protein  30.57 
 
 
139 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0812  hypothetical protein  30.43 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.580195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20020  hypothetical protein  33.58 
 
 
158 aa  80.9  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000359869  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2425  hypothetical protein  29.03 
 
 
159 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0090  hypothetical protein  28.38 
 
 
126 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.63908  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0966  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.9 
 
 
138 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.498786  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0039  hypothetical protein  31.29 
 
 
169 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000944942  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2931  putative NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
166 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0031  hypothetical protein  27.59 
 
 
169 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000221456  normal  0.0655494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0059  hypothetical protein  25.88 
 
 
170 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0123  hypothetical protein  27.01 
 
 
169 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2326  hypothetical protein  25.45 
 
 
169 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.3184  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1961  hypothetical protein  25.45 
 
 
169 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000557384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1840  hypothetical protein  25.45 
 
 
170 aa  62  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.381099  normal  0.11418 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0037  hypothetical protein  25.99 
 
 
170 aa  61.6  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.151182  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0891  hypothetical protein  26.22 
 
 
159 aa  60.8  0.00000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000165233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  44.44 
 
 
78 aa  58.2  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
143 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  43.48 
 
 
92 aa  54.7  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0555  DsrE family protein  28.46 
 
 
130 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0210711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0793  hypothetical protein  23.6 
 
 
200 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000045266  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  36.76 
 
 
99 aa  52.8  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  36.76 
 
 
84 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  36.76 
 
 
84 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  36.76 
 
 
84 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  48.15 
 
 
84 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0964  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  52  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  48.15 
 
 
84 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 
81 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  48.15 
 
 
78 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  48.15 
 
 
84 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  38.1 
 
 
83 aa  51.6  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  33.82 
 
 
81 aa  51.2  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  45.31 
 
 
75 aa  51.2  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 
81 aa  50.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  35.29 
 
 
81 aa  51.2  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  50.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  38.1 
 
 
79 aa  50.4  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  36.76 
 
 
81 aa  50.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  43.48 
 
 
83 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  35.82 
 
 
81 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  42.62 
 
 
72 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 
81 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  39.68 
 
 
89 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  35.44 
 
 
200 aa  50.1  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3727  hypothetical protein  24.03 
 
 
210 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.239652  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  32.35 
 
 
81 aa  49.7  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2900  DsrE family protein  27.48 
 
 
129 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  25.31 
 
 
140 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  34.33 
 
 
81 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  36.76 
 
 
77 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  30.14 
 
 
79 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 
81 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  34.44 
 
 
104 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.57 
 
 
201 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2420  hypothetical protein  23.68 
 
 
195 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  34.33 
 
 
86 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  44.9 
 
 
75 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  25.61 
 
 
144 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3700  hypothetical protein  24.52 
 
 
197 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.188132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  32.35 
 
 
81 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>