More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1521 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
404 aa  819    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  30.95 
 
 
556 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  34.6 
 
 
502 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.61 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.26 
 
 
563 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2574  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 
496 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840263 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  33.06 
 
 
715 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.62 
 
 
590 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.59 
 
 
678 aa  106  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  30.38 
 
 
472 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 
480 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.42 
 
 
455 aa  103  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  26.18 
 
 
716 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.4 
 
 
708 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  29.27 
 
 
451 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.76 
 
 
536 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.48 
 
 
543 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.91 
 
 
507 aa  99.8  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  25.65 
 
 
362 aa  99.8  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0619  putative PAS/PAC sensor protein  31.82 
 
 
391 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  26.37 
 
 
396 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  24.73 
 
 
706 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  30.24 
 
 
637 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.43 
 
 
1017 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  30.34 
 
 
650 aa  96.3  8e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25.29 
 
 
644 aa  96.7  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  29.05 
 
 
1087 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  24.28 
 
 
404 aa  96.3  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  27.03 
 
 
631 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.78 
 
 
516 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  27.92 
 
 
438 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  25.81 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4921  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.04 
 
 
549 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.923256  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  30.04 
 
 
671 aa  94.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.04 
 
 
606 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.87 
 
 
410 aa  94  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  29.38 
 
 
340 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  26.87 
 
 
705 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.05 
 
 
1087 aa  93.2  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.49 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  25.88 
 
 
645 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  27.56 
 
 
840 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  26.44 
 
 
723 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.63 
 
 
423 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 
487 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.15 
 
 
648 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.53 
 
 
957 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  28.05 
 
 
682 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  28.41 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  27.37 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.62 
 
 
526 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  22.63 
 
 
404 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.51 
 
 
1480 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1248 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  26.1 
 
 
817 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  26.1 
 
 
817 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.81 
 
 
705 aa  89.7  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.9 
 
 
560 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.86 
 
 
1004 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
775 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  25.41 
 
 
445 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0442  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.13 
 
 
421 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723738  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  29.52 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.96 
 
 
396 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.77 
 
 
549 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.56 
 
 
684 aa  88.6  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  27.31 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.86 
 
 
1079 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.4 
 
 
393 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35020  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  27.78 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.4 
 
 
393 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 
642 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  24.51 
 
 
657 aa  87  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  28.28 
 
 
642 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  25.41 
 
 
445 aa  87  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  25.9 
 
 
486 aa  87.4  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 
385 aa  87  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  27.84 
 
 
519 aa  86.7  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 
967 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  23.14 
 
 
413 aa  86.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.98 
 
 
738 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 
967 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  24.51 
 
 
643 aa  86.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 
649 aa  86.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.32 
 
 
384 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.88 
 
 
748 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.37 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.6 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  28.95 
 
 
688 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.72 
 
 
961 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.4 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  25.17 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.4 
 
 
997 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  28.74 
 
 
643 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  27.86 
 
 
535 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  26.34 
 
 
781 aa  84.3  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  32.8 
 
 
693 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  25.69 
 
 
683 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  26.44 
 
 
660 aa  84  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>