More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1468 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 303 aa  591  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.35 
 
 		 299 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  45.17 
 
 		 311 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.17 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  41.38 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  44.37 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  42.12 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  42.86 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  43.3 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.52 
 
 		 283 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  43.37 
 
 		 310 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  43.96 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  39.01 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  38.99 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  41.82 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  41.26 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  42.5 
 
 		 312 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  39.3 
 
 		 298 aa  177  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  43.8 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  40.75 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  38.43 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  40.66 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  40.38 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  40.38 
 
 		 291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40.37 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  37.37 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  33.57 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  35.54 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  35.54 
 
 		 308 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  35.89 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  36.51 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  37.23 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  37.23 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  37.23 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  34.84 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  34.95 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  40.15 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  35.07 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  35.07 
 
 		 308 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  36.86 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  36.86 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  36.86 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  38 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  38.15 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  42.64 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  37.5 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  34.93 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0902  hypothetical protein  40.3 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.499598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  34.83 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.71 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.86 
 
 		 298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 290 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.94 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  31.34 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  32.98 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  34.6 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0367  hypothetical protein  27.96 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.198495  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  34.25 
 
 		 321 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  27.11 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.48 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  31.21 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  32.29 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 		 313 aa  96.3  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  31.41 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  34.54 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.06 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  32.85 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4726  hypothetical protein  41.61 
 
 		 156 aa  85.9  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.11 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  28.72 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  30.67 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.21 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  27.9 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.16 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  44.44 
 
 		 119 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.34 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  27.69 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.5 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.12 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  30.51 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  29.57 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  30.74 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  29.13 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  31.95 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  25.29 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  29.67 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.93 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>