More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1431 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1431  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 343 aa  671    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0268  AraC family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1825  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.86634  normal  0.723243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1439  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4508  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.177726  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1478  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.010592  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4014  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3797  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000195547 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5438  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22640  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23660  Transcription activator in PHB biosynthesis, AraC family  33.75 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00474506  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1128  transcriptional regulator, AraC family  31.48 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1557  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 344 aa  146  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0616  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1911  putative transcriptional regulator  35.09 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3219  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2342  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 335 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4941  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  30.06 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0042  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1792  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 359 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24920  putative transcriptional regulator  32.59 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0725  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 342 aa  133  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4117  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 341 aa  132  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344929 
 
 
-
 
NC_003296  RS03889  transcription regulator protein  30.61 
 
 		 339 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1997  hypothetical protein  29.63 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4290  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 336 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.431185 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2002  hypothetical protein  29.34 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6019  transcriptional regulator, Fis family  34.62 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2934  transcriptional regulator, AraC family  31.41 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0030  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2131  AraC family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4068  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 355 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2480  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4690  transcriptional regulator OruR  33.58 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0206  AraC family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4369  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 337 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1252  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 336 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2321  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 347 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.197837  normal  0.0103816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0506  helix-turn-helix domain-containing protein  28.68 
 
 		 346 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53520  transcriptional regulator OruR  33.21 
 
 		 339 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000827107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1868  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4447  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5598  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 349 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4254  AraC family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2042  putative transcriptional regulator  30.94 
 
 		 340 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0108  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 347 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3652  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 340 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05257  hypothetical protein  29.03 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4360  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2261  helix-turn-helix domain-containing protein  29.2 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.987084  normal  0.387079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3431  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 341 aa  112  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.147255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2021  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 396 aa  112  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0324  helix-turn-helix, AraC type  29.49 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.556334  normal  0.399612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0523  helix-turn-helix domain-containing protein  30.53 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1666  helix-turn-helix-domain-containing protein  25.88 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2953  AraC family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0291809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2038  helix-turn-helix domain-containing protein  32.64 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980028  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5783  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.737576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2808  transcriptional regulator, AraC family  31.99 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2989  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 348 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3485  AraC family transcriptional regulator  31.99 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5548  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2760  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7337  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 336 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.82009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2942  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00260427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49150  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 333 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000236586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24140  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 345 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.434132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2577  AraC family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.25861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4197  transcriptional regulator  39.75 
 
 		 333 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2328  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 346 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5276  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3194  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.857429  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1029  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.221048  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2784  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00366686  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1690  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.282815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2972  AraC family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.183535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5220  transcriptional regulator, AraC family  28.75 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0701  helix-turn-helix-domain-containing protein  29.36 
 
 		 345 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0122  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.28926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0451  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1389  transcriptional regulator, AraC family  23.15 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.734423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1538  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4868  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2004  AraC family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4331  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6759  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2075  helix-turn-helix domain-containing protein  30.55 
 
 		 348 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000856929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4237  AraC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.339126  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3757  helix-turn-helix domain-containing protein  31.6 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0134  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3011  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.476287  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5228  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3110  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2076  helix-turn-helix domain-containing protein  28.05 
 
 		 343 aa  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000022651  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4110  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>