127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1395 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  100 
 
 
941 aa  1879    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  45.92 
 
 
1187 aa  304  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  44.75 
 
 
1207 aa  301  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  43.38 
 
 
544 aa  268  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  38.8 
 
 
1147 aa  268  5e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  46.24 
 
 
535 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  42.62 
 
 
817 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  45.65 
 
 
787 aa  247  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  44.07 
 
 
602 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  43.8 
 
 
778 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  42.21 
 
 
447 aa  229  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  39.4 
 
 
454 aa  228  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  43.47 
 
 
792 aa  225  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  42.86 
 
 
776 aa  225  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  41.96 
 
 
784 aa  220  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.41 
 
 
837 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.21 
 
 
553 aa  213  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  46.61 
 
 
326 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  38.79 
 
 
389 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.71 
 
 
556 aa  171  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  37.33 
 
 
554 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1756  putative lipoprotein  30.18 
 
 
483 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  hitchhiker  0.00776074 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  36.9 
 
 
593 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  36.67 
 
 
376 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  36.14 
 
 
618 aa  155  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  33.15 
 
 
579 aa  146  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  34.54 
 
 
558 aa  144  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  34.37 
 
 
477 aa  143  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  34.39 
 
 
569 aa  142  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.42 
 
 
555 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  31.4 
 
 
551 aa  139  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.09 
 
 
821 aa  138  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.97 
 
 
561 aa  137  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.96 
 
 
577 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.13 
 
 
818 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  29.67 
 
 
449 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  33.05 
 
 
554 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.05 
 
 
810 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.01 
 
 
563 aa  129  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.97 
 
 
570 aa  128  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.52 
 
 
567 aa  128  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  33.9 
 
 
553 aa  127  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  34.75 
 
 
681 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.15 
 
 
403 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.02 
 
 
546 aa  124  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  33.16 
 
 
1848 aa  124  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  33.65 
 
 
558 aa  120  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.09 
 
 
555 aa  120  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.08 
 
 
417 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  31.82 
 
 
566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  29.77 
 
 
743 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  33.99 
 
 
560 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  31.41 
 
 
1919 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.41 
 
 
341 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.9 
 
 
1679 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  31.11 
 
 
911 aa  109  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.46 
 
 
706 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  31.12 
 
 
2082 aa  104  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  27.71 
 
 
575 aa  102  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.35 
 
 
469 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.23 
 
 
714 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  32.41 
 
 
443 aa  97.4  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  26.39 
 
 
461 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  30.33 
 
 
745 aa  96.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  30.03 
 
 
363 aa  95.9  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  30.03 
 
 
363 aa  96.3  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  32.44 
 
 
835 aa  95.5  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2789  hypothetical protein  43.75 
 
 
133 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316078  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  30.31 
 
 
717 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  28.39 
 
 
643 aa  92  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  30.77 
 
 
14609 aa  91.3  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  31.55 
 
 
900 aa  91.3  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  28.94 
 
 
396 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  28.76 
 
 
533 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  27.78 
 
 
547 aa  88.6  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  32.37 
 
 
638 aa  88.6  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4353  hypothetical protein  29.69 
 
 
437 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.745279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  30.25 
 
 
737 aa  86.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.64 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  27.02 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  30.77 
 
 
726 aa  85.5  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  30.25 
 
 
461 aa  84.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 
547 aa  83.6  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.67 
 
 
692 aa  84  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_4127  predicted protein  28.72 
 
 
390 aa  83.2  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.048963  normal  0.0914218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  29.21 
 
 
1222 aa  82  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  27.13 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  28.29 
 
 
1129 aa  81.6  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  30.24 
 
 
590 aa  81.3  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  26.6 
 
 
728 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.67 
 
 
807 aa  79.3  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  26.4 
 
 
499 aa  79  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  26.71 
 
 
643 aa  77.8  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  27.2 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.36 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28587  predicted protein  30.18 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  27.95 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.19 
 
 
624 aa  70.1  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  27.65 
 
 
371 aa  68.6  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  28.1 
 
 
328 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>