More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1341 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1341  aminotransferase class V  100 
 
 		 377 aa  761    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2207  aminotransferase, class V  52 
 
 		 381 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3040  aminotransferase, class V  54.26 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130075  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0554  aminotransferase, class V  54.65 
 
 		 355 aa  382  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.721131  hitchhiker  0.00373299 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02090  hypothetical protein  37.57 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.468544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2438  aminotransferase class V  38.6 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5353  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.11849 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7397  Selenocysteine lyase  38.16 
 
 		 382 aa  268  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3773  aminotransferase class V  42.89 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03589  aminotransferase, class V superfamily  35.83 
 
 		 393 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.301675  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45663  predicted protein  32.93 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4343  selenocysteine lyase  34.23 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4490  aminotransferase class V  31.85 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0650155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4479  aminotransferase class V  33.69 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4498  aminotransferase class V  33.79 
 
 		 384 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2765  aminotransferase class V  32.17 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0737  aminotransferase, class V  28.92 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1866  aminotransferase class V  30.33 
 
 		 387 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1637  aminotransferase, class V  31.74 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.681858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0911  aminotransferase, class V  30.32 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1720  hypothetical protein  32.49 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0138813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1656  aminotransferase, class V  26.97 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000223228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1280  hypothetical protein  32.05 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.586224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1413  aminotransferase, class V  29.59 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354567  normal  0.630226 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5290  aminotransferase class V  30.96 
 
 		 380 aa  116  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00731204  normal  0.0470255 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5082  aminotransferase class V  29.12 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000086974  normal  0.0923906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25790  hypothetical protein  28.65 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.226944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15030  cysteine desulfurase protein  29.32 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2203  hypothetical protein  28.17 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0008  aminotransferase, class V  28.7 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4955  aminotransferase class V  26.65 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2373  aminotransferase, class V  28.76 
 
 		 378 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0788  aminotransferase class V  28.39 
 
 		 367 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0034  aminotransferase class V  22.6 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.163206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1071  aminotransferase, class V  29.47 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1533  aminotransferase class V  29.28 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.172669  normal  0.519626 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1255  L-cysteine/cystine lyase  27.32 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0542203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1864  aminotransferase class V  30.11 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.126544  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6148  aminotransferase class V  24.67 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4866  aminotransferase, class V  23.8 
 
 		 401 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.403598  unclonable  0.000000172014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4777  aminotransferase, class V  29.58 
 
 		 391 aa  96.3  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0469336 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1250  aminotransferase class V  27.73 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3348  aminotransferase class V  25.37 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2945  aminotransferase, class V  32.08 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4470  kynureninase  29.19 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3417  kynureninase  25.29 
 
 		 371 aa  88.6  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.746937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5365  aminotransferase class V  28.94 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262525  normal  0.71759 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1377  aminotransferase, class V  26.63 
 
 		 390 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3584  aminotransferase class V  25.53 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3088  aminotransferase class V  28.42 
 
 		 374 aa  87  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1471  kynureninase  29.19 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0396616  normal  0.0356277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0411  aminotransferase, class V  24.15 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2502  aminotransferase class V  24.43 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0822  kynureninase  27.19 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.632925  hitchhiker  0.00000920194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1973  aminotransferase class V  34.5 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000551025  unclonable  0.0000000445037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0767  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.815381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0665  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1687  cysteine desulfurase family protein  31.6 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0185  aminotransferase, class V  22.14 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.119153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0933  aminotransferase class V  32.05 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3723  aminotransferase class V  26.95 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.15701  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8515  aminotransferase class V  27.51 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1463  aminotransferase class V  28.11 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0778  aminotransferase class V  25 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4543  aminotransferase class V  23.14 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1811  aminotransferase class V  27.11 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747034  hitchhiker  0.00000000219699 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2304  aminotransferase class V  27.18 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00866664  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0805  aminotransferase class V  24.75 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4359  aminotransferase, class V  30.39 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2612  aminotransferase class V  28.38 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  34.5 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5012  aminotransferase class V  26.02 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17260  selenocysteine lyase  26.02 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.118877  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0407  aminotransferase, class V  25.47 
 
 		 373 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.482772  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1903  kynureninase  24.39 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.880029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3072  aminotransferase class V  27.38 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237704  decreased coverage  0.0000000313902 
 
 
-
 
NC_003296  RS01753  putative isopenicillin N epimerase protein  29.85 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73332  normal  0.379334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1584  aminotransferase class V  31.53 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1785  aminotransferase class V  31.71 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895354  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2439  kynureninase  29.72 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0300  aminotransferase class V  25.47 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1984  aminotransferase class V  31.69 
 
 		 345 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.817831  hitchhiker  0.0000368323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6512  kynureninase  26.97 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5187  class-V aminotransferase  30.59 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1785  aminotransferase class V  30.12 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  23.19 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1156  kynureninase  30.5 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.490067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1389  kynureninase  28.21 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0130616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0721  aminotransferase class V  22.39 
 
 		 389 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5724  aminotransferase class V  25.51 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0305  aminotransferase class V  25.47 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0775  putative isopenicillin N epimerase  24.87 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0692  putative isopenicillin N epimerase  24.87 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0028  hypothetical protein  29.43 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2417  putative aminotransferase class-V  24.87 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.526111  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0309  aminotransferase class V  25.16 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1140  isopenicillin N epimerase  24.87 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1739  putative isopenicillin N epimerase  24.87 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2313  cysteine desulfurase family protein  32.23 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4459  aminotransferase class V  27.5 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  unclonable  0.0000000253677  hitchhiker  0.00260881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>