91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1293 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  773    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  47.3 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 395 aa  286  4e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13440  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1304  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1662  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1115  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.948444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2967  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 392 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1174  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 394 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0309  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.265647  normal  0.0116051 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  30.71 
 
 		 393 aa  159  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  31.22 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  28.46 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0776  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1163  hypothetical protein  31.27 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38877  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  25.54 
 
 		 440 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08768  conserved hypothetical protein  24.35 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0863373  normal  0.186532 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45095  conserved hypothetical membrane protein  22.11 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.562888 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1174  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.394628  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01506  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05090)  26.94 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  22.13 
 
 		 391 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28819  predicted protein  21.22 
 
 		 505 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00143526 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  21.86 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0483  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0130  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.453953  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07240  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17270)  27.57 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  25.3 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  25 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31239  predicted protein  22.01 
 
 		 507 aa  63.2  0.000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.144771  normal  0.813098 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3270  hypothetical protein  23.88 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3044  hypothetical protein  23.88 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00880496  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3279  hypothetical protein  23.88 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  24.66 
 
 		 423 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01310  conserved hypothetical protein  25.51 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  24.32 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0901  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3382  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 398 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3964  transporter, putative  26.93 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000523123  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  25.89 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0005  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0753564  normal  0.228788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  25.52 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1762  major facilitator superfamily (MFS)transporter  27.67 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112506  normal  0.0259533 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  24.32 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  25.59 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  24.71 
 
 		 474 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  29 
 
 		 391 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  26.13 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  22.87 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0066  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  25.26 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3989  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 406 aa  47.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  24.75 
 
 		 423 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2123  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.226237  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59269  predicted protein  26.98 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.245498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4287  major facilitator transporter  23.55 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000504378  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  25.24 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2340  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 		 417 aa  46.6  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 406 aa  46.6  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0067  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.700351  unclonable  0.0000000000855622 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0067  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37883  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0065  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.596651  decreased coverage  0.0000000729069 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  25.08 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0063  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0580428  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  23.94 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  31.33 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  23.49 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  24.89 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  24.57 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  31.52 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  25.32 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  25.36 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  23.27 
 
 		 274 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  25.65 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  26.24 
 
 		 410 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  27.91 
 
 		 437 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  29.1 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  24.42 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04660  Major Facilitator Superfamily transporter  32.42 
 
 		 393 aa  43.5  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  28.57 
 
 		 435 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00677  transporter, putative  31.69 
 
 		 405 aa  42.7  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00179637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  24.89 
 
 		 431 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1819  transporter, putative  35.71 
 
 		 399 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>