110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1291 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1291  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 310 aa  643    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1476  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119784 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5689  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.688705  normal  0.172717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1702  hypothetical protein  28.96 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0534868  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6312  hypothetical protein  28.96 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.668118  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1767  hypothetical protein  28.96 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5065  hypothetical protein  28.06 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.613566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1780  hypothetical protein  27.91 
 
 		 292 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.475693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  22.13 
 
 		 649 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.33 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.19 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0254  hypothetical protein  41.3 
 
 		 471 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  32.77 
 
 		 474 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  30.89 
 
 		 486 aa  52.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  34.69 
 
 		 428 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2651  Radical SAM domain protein  33.03 
 
 		 415 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.135076 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  37.63 
 
 		 455 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.33 
 
 		 341 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 344 aa  49.7  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  33.67 
 
 		 274 aa  49.3  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.5 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  32.99 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 415 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0827  radical SAM family protein  38.37 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.731351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  29.55 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  36.78 
 
 		 776 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5711  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 565 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 429 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.97 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  38.96 
 
 		 348 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  32.65 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0022  hypothetical protein  32.14 
 
 		 336 aa  47.8  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  35.63 
 
 		 479 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2446  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  34.74 
 
 		 336 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.68 
 
 		 325 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  35.25 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.91 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2711  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.01 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.122417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4200  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 330 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341727  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1947  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.63 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.386779 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.99 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6192  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0225613 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2461  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.52 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.37 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3511  Radical SAM domain protein  28.7 
 
 		 475 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000437292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3273  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  34.18 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1699  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.440195  hitchhiker  0.000169379 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  36.14 
 
 		 418 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.38 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2795  radical SAM domain-containing protein  35.63 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.420815  hitchhiker  0.00106438 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5946  molybdopterin biosynthesis, protein A  30.61 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302426  normal  0.0104705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2266  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.7 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00162832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  34.38 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  34.38 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  28.72 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  34.04 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  35.51 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  38.14 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  31.82 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3397  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.08 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  31.96 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 		 391 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.85 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6662  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  35.14 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.18 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2597  radical SAM domain-containing protein  34.48 
 
 		 523 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.054698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.06 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1242  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.03 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00350809  normal  0.534968 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.97 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6342  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  34.58 
 
 		 384 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00364932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  32.93 
 
 		 279 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.28 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1219  radical SAM family protein  32.99 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.38 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3299  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 347 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 356 aa  42.7  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>