235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1262 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1429 aa  2826    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1088 aa  205  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.6 
 
 		 1424 aa  195  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  32.66 
 
 		 1105 aa  166  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  27.15 
 
 		 979 aa  161  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 924 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.07 
 
 		 2145 aa  154  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1526 aa  145  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.71 
 
 		 1068 aa  138  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 454 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1404 aa  137  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.34 
 
 		 1328 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1550 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  29.01 
 
 		 1611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  29 
 
 		 1020 aa  127  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.22 
 
 		 771 aa  127  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  27.29 
 
 		 799 aa  125  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 1215 aa  121  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  30.91 
 
 		 1290 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  32.34 
 
 		 443 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.32 
 
 		 787 aa  119  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 911 aa  118  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 		 857 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 1507 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.13 
 
 		 885 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.35 
 
 		 1039 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.82 
 
 		 1040 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 444 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 568 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.45 
 
 		 568 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.09 
 
 		 694 aa  109  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1238 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.88 
 
 		 767 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  36.1 
 
 		 284 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 953 aa  102  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.95 
 
 		 828 aa  101  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.15 
 
 		 1044 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.3 
 
 		 836 aa  100  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 1714 aa  99  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  30.79 
 
 		 1914 aa  98.6  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  28.9 
 
 		 966 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.29 
 
 		 919 aa  96.3  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 1288 aa  95.9  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  25.51 
 
 		 686 aa  95.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  26.46 
 
 		 807 aa  95.9  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.63 
 
 		 1050 aa  94  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 843 aa  92  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.88 
 
 		 1186 aa  90.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 751 aa  88.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.27 
 
 		 782 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 725 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 		 949 aa  87.8  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 814 aa  87.8  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  29.32 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 878 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.8 
 
 		 825 aa  86.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 		 1313 aa  84.3  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.44 
 
 		 732 aa  84.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.23 
 
 		 1228 aa  84  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 991 aa  84.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  31.44 
 
 		 311 aa  83.2  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.51 
 
 		 740 aa  83.2  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  31.03 
 
 		 680 aa  82  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.91 
 
 		 810 aa  81.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  28.18 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  28.98 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.52 
 
 		 1131 aa  78.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.92 
 
 		 822 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.4 
 
 		 212 aa  78.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.97 
 
 		 977 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  30.98 
 
 		 702 aa  76.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1063 aa  75.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  26.28 
 
 		 2327 aa  75.1  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.05 
 
 		 1123 aa  74.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4099  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1339 aa  73.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0326022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1028 aa  73.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  23.02 
 
 		 731 aa  72.8  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 1101 aa  71.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 1435 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.33 
 
 		 1036 aa  69.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.7 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1212 aa  68.6  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43236  predicted protein  25.7 
 
 		 1452 aa  67  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.466991  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  21.42 
 
 		 708 aa  67.8  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 909 aa  67.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4168  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 		 326 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 828 aa  67.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1359  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 333 aa  66.6  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.98 
 
 		 957 aa  67  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.73 
 
 		 1180 aa  67  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.44 
 
 		 816 aa  66.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.69 
 
 		 919 aa  65.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.4 
 
 		 2413 aa  65.9  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  65.1  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  31.17 
 
 		 440 aa  65.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 785 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 632 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 1596 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 481 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.87 
 
 		 733 aa  63.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>