More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1218 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 485 aa  965    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  75.78 
 
 		 479 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  75.16 
 
 		 479 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  98.35 
 
 		 485 aa  947    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  76.2 
 
 		 479 aa  675    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  74.95 
 
 		 463 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  75.78 
 
 		 479 aa  695    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  34.69 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03900  hypothetical protein  29.63 
 
 		 998 aa  173  6.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.114045  normal  0.665551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  31.09 
 
 		 796 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  33.53 
 
 		 647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  32.28 
 
 		 652 aa  163  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  31.16 
 
 		 650 aa  159  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  31.66 
 
 		 654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 		 444 aa  151  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01111  hypothetical protein  28.38 
 
 		 778 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  31.21 
 
 		 451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  31.05 
 
 		 794 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  29.65 
 
 		 809 aa  143  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  29.65 
 
 		 809 aa  143  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  30.38 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  29.91 
 
 		 795 aa  139  8.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.35 
 
 		 531 aa  139  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  27.96 
 
 		 491 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 		 799 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  30.14 
 
 		 796 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  29.18 
 
 		 786 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.68 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 784 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  30.83 
 
 		 444 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  30.19 
 
 		 443 aa  133  6e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  30.32 
 
 		 768 aa  133  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  28.76 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  31.28 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  26 
 
 		 971 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  29.23 
 
 		 630 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  30.49 
 
 		 788 aa  126  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  25.75 
 
 		 925 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.25 
 
 		 555 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5449  type III restriction protein res subunit  29.84 
 
 		 815 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.788934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1416  type III restriction protein, res subunit  26.48 
 
 		 920 aa  125  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  28.53 
 
 		 773 aa  124  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.91 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 		 813 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 		 813 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 		 590 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  29.53 
 
 		 785 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 440 aa  120  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  28.38 
 
 		 548 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  26.63 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  26.9 
 
 		 629 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 		 509 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  27.65 
 
 		 548 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  28.25 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  29.23 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  27.95 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  28.61 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  27.58 
 
 		 451 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  27.15 
 
 		 456 aa  113  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  28.49 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  29.48 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.6 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.69 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  28.96 
 
 		 548 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  27.74 
 
 		 602 aa  110  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 		 479 aa  110  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  28.97 
 
 		 462 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.45 
 
 		 666 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  29.66 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 494 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.62 
 
 		 548 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  31.65 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.73 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  30.53 
 
 		 607 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 		 993 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  24.78 
 
 		 967 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  29.49 
 
 		 550 aa  104  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  30.66 
 
 		 649 aa  103  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  29.69 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  28.22 
 
 		 1077 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  28.65 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  30.34 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  25.58 
 
 		 590 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  24.31 
 
 		 905 aa  101  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  24.93 
 
 		 949 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  24.86 
 
 		 564 aa  100  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  27.92 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  27.86 
 
 		 554 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 1029 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  27.59 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  27.95 
 
 		 559 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 		 967 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>