149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1190 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 79 aa  155  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  98.72 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  97.47 
 
 		 79 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  94.94 
 
 		 79 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  62.86 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  58.57 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  58.57 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  53.62 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  61.29 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  52.78 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  46.38 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  43.21 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5790  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 90 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.902407  hitchhiker  0.00485473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0540  helix-turn-helix domain-containing protein  38.36 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.229999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5917  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.58 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.19317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.28 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.47 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2086  helix-turn-helix domain protein  38.6 
 
 		 327 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0272363  normal  0.126806 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6155  hypothetical protein  40.3 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42038  hitchhiker  0.000659717 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  32.89 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  40 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  31.75 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  31.75 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.79 
 
 		 508 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  31.75 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1892  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.883347  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0099  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  34.29 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3463  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2819  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 261 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  36.76 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 513 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2643  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 64 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  32.89 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  31.15 
 
 		 255 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1721  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  35.38 
 
 		 272 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1519  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0937641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 256 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2016  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  46.15 
 
 		 516 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2559  transcriptional regulator, XRE family  30.16 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  39.62 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  37.29 
 
 		 115 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 179 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  35.29 
 
 		 181 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 188 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>