More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1173 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.35 
 
 
1827 aa  870    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  35.48 
 
 
2220 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  37.22 
 
 
3176 aa  690    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  39.72 
 
 
2333 aa  885    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 
1939 aa  1014    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 
7279 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  34.58 
 
 
3101 aa  873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.78 
 
 
1337 aa  674    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  37.12 
 
 
2719 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  41.8 
 
 
2232 aa  1050    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.81 
 
 
2225 aa  875    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  33.2 
 
 
2126 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  39.98 
 
 
1087 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
7110 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
2551 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
1874 aa  1125    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  42.38 
 
 
1656 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  43.3 
 
 
1144 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  42.03 
 
 
1587 aa  711    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  100 
 
 
1966 aa  3968    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.14 
 
 
2890 aa  1001    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  33.23 
 
 
2462 aa  870    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.56 
 
 
1822 aa  976    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.6 
 
 
2136 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1172  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.21 
 
 
1372 aa  672    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.12 
 
 
1349 aa  747    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  35.92 
 
 
3508 aa  670    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.58 
 
 
3111 aa  879    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  39.1 
 
 
2230 aa  987    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  36.3 
 
 
1832 aa  930    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  35.57 
 
 
1349 aa  741    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  33.48 
 
 
4080 aa  741    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  34.04 
 
 
2085 aa  669    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  33.77 
 
 
3408 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.11 
 
 
2551 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  30.22 
 
 
1909 aa  855    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 
1354 aa  655    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  40.27 
 
 
1559 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  35.61 
 
 
4183 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.02 
 
 
1559 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 
3693 aa  677    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  37.32 
 
 
3670 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  34.04 
 
 
2085 aa  669    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.45 
 
 
3676 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  36.26 
 
 
2108 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 
3696 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  36.52 
 
 
1805 aa  662    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  42.93 
 
 
3449 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  31.13 
 
 
1744 aa  661    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.46 
 
 
1867 aa  740    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  33.36 
 
 
2108 aa  652    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  39.36 
 
 
3930 aa  730    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.78 
 
 
1804 aa  919    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  33.73 
 
 
2111 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.73 
 
 
1909 aa  987    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 
3702 aa  675    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  34.11 
 
 
2085 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  38.95 
 
 
3424 aa  654    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.94 
 
 
3679 aa  672    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.5 
 
 
3645 aa  866    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.64 
 
 
3427 aa  637    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  34.05 
 
 
1806 aa  842    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 
7210 aa  635  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  42.82 
 
 
1822 aa  636  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  35.94 
 
 
1831 aa  631  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  35.49 
 
 
3494 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.86 
 
 
4478 aa  633  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 
5255 aa  632  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 
5154 aa  632  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  35.22 
 
 
2126 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.8 
 
 
1789 aa  629  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  40.25 
 
 
1114 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  36.64 
 
 
3158 aa  621  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  35.47 
 
 
4151 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  32.78 
 
 
2188 aa  619  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
1190 aa  620  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
1190 aa  620  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  40.21 
 
 
1812 aa  618  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.84 
 
 
1305 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 
1190 aa  616  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  37.36 
 
 
2966 aa  615  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.25 
 
 
2762 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
3874 aa  611  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
1816 aa  609  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  34.45 
 
 
2277 aa  609  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1178  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.05 
 
 
950 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  32.74 
 
 
2101 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  36.66 
 
 
6768 aa  600  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  39.48 
 
 
3281 aa  600  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 
2545 aa  603  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 
2544 aa  603  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  36.76 
 
 
2544 aa  603  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 
4930 aa  603  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  38.16 
 
 
1601 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  36.39 
 
 
3493 aa  598  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  40.08 
 
 
1584 aa  598  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  33.78 
 
 
2547 aa  596  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  35.45 
 
 
2486 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  35.45 
 
 
2486 aa  595  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>